A型产气荚膜梭菌青海分离株virR基因序列与蛋白结构分析

• 作者: 冶贵生 李清
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 产气荚膜梭菌 virR基因 序列分析 蛋白结构
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学
• 页码范围: 800-805
• 页数: 6页
• 分类号: S852.61
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20190917.001

摘要

为了探究产气荚膜梭菌virR基因功能及其蛋白结构特点,提取了产气荚膜梭菌青海分离株的基因组,设计引物对virR基因进行PCR扩增和测序,使用生物软件对该基因进行序列分析和蛋白预测.结果 显示,产气荚膜梭菌分离株virR基因长为759 bp,其编码252个氨基酸;分离株virR基因与参考菌株SM101、13、ATCC 13124、CP15、Del1、EHE-NE 18、FORC 003、FORC 025、JIR4025、JP55、JP838、LLYN11、NCTC2837以及NCTC13170的virR基因核苷酸序列同源性和氨基酸同源性均在97％以上;二级结构预测显示分离株virR蛋白主要由α螺旋结构和β折叠组成;三级结构预测表明分离株virR蛋白有5种可信度较高的结构,蛋白功能位点预测表明分离株virR蛋白具有1个N-糖基化位点、1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点、3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点以及1个N-豆蔻酰化位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冶贵生	青海大学农牧学院动物医学系	30	47	3.0	4.0
2	李清	青海大学农牧学院动物医学系	1	0	0.0	0.0