仿刺参基质金属蛋白酶基因MMP-16的克隆及表达

• 作者: 周遵春 孙红娟 李石磊 杨爱馥 董颖 陈仲 高杉
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 仿刺参 基质金属蛋白酶 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 389-399
• 页数: 11页
• 分类号: Q785|S968.9
• 字数: 6705字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20171211104

摘要

基质金属蛋白酶(MMPs)是一种能够降解细胞外基质的蛋白水解酶类.为研究MMPs在仿刺参免疫防御中的作用,本实验采用RACE技术克隆了仿刺参基质金属蛋白酶16基因(Aj-MMP-16)的cDNA全长序列,并对其序列特征和功能进行了初步分析;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法,分别分析了Aj-MMP-16基因在仿刺参不同组织、不同“化皮”体壁组织以及病原菌刺激后体腔细胞中的表达情况.结果 显示,Aj-MMP-16基因的cDNA全长为2 976 bp,包括一个342 bp的5’非编码区,一个963 bp的3’非编码区;开放阅读框(ORF)为1 671 bp,编码557个氨基酸,预测蛋白分子量为63.11 ku,等电点为4.79.Aj-MMP-16具有典型的MMPs家族蛋白结构:N-端前肽区、铰链区、催化区、C-端类血红素结合区和跨膜区.Aj-MMP-16与其他物种的MMPs具有一定的相似性,与紫色球海胆的MMP-16相似性最高.Aj-MMP-16基因mRNA在仿刺参各组织中均有表达,表达量由高到低为呼吸树、肠、体腔细胞、管足、肌肉、体壁;在“化皮病”不同阶段,Aj-MMP-16基因mRNA在“化皮”体壁组织中的表达量显著高于正常体壁组织;灿烂弧菌和蜡样芽孢杆菌刺激后,体腔细胞中Aj-MMP-16基因mRNA表达量显著升高.Aj-MMP-16基因可能在仿刺参内脏再生、炎症发生以及免疫应答中起着重要的作用.