宏基因组测序在临床重症感染患者寻找病原体中的应用

• 作者: 宗志勇 张中伟 权敏 王晓辉 苟雪静
• 来源期刊: 四川大学学报（医学版）
• 关键词: 宏基因组测序 巨细胞病毒感染 耐药细菌 重症胰腺炎
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 临床医学
• 页码范围: 425-428
• 页数: 4页
• 语种: 中文

摘要

目的 应用宏基因组测序检测重症患者感染病原体,了解在重症患者中的应用对寻找感染病原体的帮助.方法 对1例表现为腹痛、逐渐进展至意识障碍合并严重感染的急性重症胰腺炎患者,用传统方法 检测病原体的同时应用宏基因组测序.传统方法包括:常规涂片、培养,VitekⅡ Compact全自动微生物鉴定和药敏分析,实时荧光定量PCR检测病毒载量,以及免疫组织化学等病理检查.宏基因组测序则采用基于BGISEQ-100高通量测序平台的二代测序,剔除人类宿主序列后,将保留下来的序列与包含病毒、细菌、真菌和寄生虫基因组序列的微生物基因组数据库进行比对,确定标本中所有的病原体.结果 传统检验发现该患者感染了耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌、耐碳青霉烯的肺炎克雷伯菌和耐碳青霉烯的鲍曼不动杆菌.宏基因组测序结果不仅检出了前述病原体,还检查出了加重疾病恶化的巨细胞病毒(CMV),耗时约5d.实时荧光定量PCR补充病毒载量检测证实其CMV载量为189 000 copies/mL.结论 在本例重症患者中,宏基因组测序一次性快速准确检出了3种病原菌和1种病毒,可辅助重症患者感染病的快速诊断.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宗志勇	四川大学华西医院感染性疾病中心	85	390	12.0	16.0
10	张中伟	四川大学华西医院重症医学科	36	151	6.0	11.0
11	王晓辉	四川大学华西医院感染性疾病中心	29	215	9.0	14.0
15	权敏	四川大学华西医院感染性疾病中心	1	3	1.0	1.0