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摘要:
目的 研究靶向敲除CDK2对人黑素瘤移植瘤中miRNA表达谱的影响.方法 设计CDK2的sgRNA靶向序列,构建含有sgCDK2-108的重组CRISP/Cas9慢病毒质粒并转染至HEK293T细胞进行重组慢病毒的包装和纯化.在SPF级的BALB/c-nude小鼠右前肢腋下皮下注射1×10 7个人黑素瘤细胞A375进行体外移植瘤小鼠模型构建.移植瘤成瘤第35天时,瘤内注射1×107 TU的重组sgCDK2-108和sgCDK2-NC慢病毒并继续培养30 d后收集样本.miRNA高通量测序检测靶向敲除CDK2后移植瘤内miRNA表达谱的改变、进行miRNA靶基因、GO富集分析、KEGG通路分析、新型miRNA鉴定及二级结构预测.结果 sgCDK2-108慢病毒感染组与sgCDK2-NC阴性慢病毒感染组相比,共鉴定出762个miRNA,其中上调表达35个miRNA、下调表达13个miRNA;与移植瘤组相比,共鉴定出754个miRNA,其中上调表达28个miRNA、下调表达4个miRNA.miR-1 a-3p、miR-133a-3p、miR-133b-3p和miR-375-3p为共同差异表达miRNA且具有多个潜在靶分子.GO分析显示miRNA靶基因功能主要为细胞代谢调控等,KEGG通路分析显示主要涉及RNA降解和自噬等.共鉴定出290个新型miRNA且具有“V”型或“直线”型两种结构.结论 靶向敲除CDK2能够改变人黑素瘤移植瘤内的miRNA表达谱.
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文献信息
篇名 靶向敲除CDK2对人黑素瘤移植瘤中miRNA表达谱的影响
来源期刊 中国皮肤性病学杂志 学科 医学
关键词 人黑素瘤 CDK2 A375 移植瘤
年,卷(期) 2019,(12) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 1354-1360
页数 7页 分类号 R739.5
字数 语种 中文
DOI 10.13735/j.cjdv.1001-7089.201904098
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 苏萌 11 20 3.0 4.0
2 李丹 16 30 3.0 5.0
3 谢广成 7 4 1.0 1.0
4 刘厚广 1 0 0.0 0.0
5 李铮 1 0 0.0 0.0
6 霍珊珊 1 0 0.0 0.0
7 魏琼玲 1 0 0.0 0.0
8 葛铃 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
人黑素瘤
CDK2
A375
移植瘤
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国皮肤性病学杂志
月刊
1001-7089
61-1197/R
大16开
陕西省西安市西五路157号
52-17
1987
chi
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9358
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21
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