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肿瘤微环境细胞亚群基因标签预测复发转移性头颈鳞状细胞癌EGFR单抗疗效*
肿瘤微环境细胞亚群基因标签预测复发转移性头颈鳞状细胞癌EGFR单抗疗效*
作者:
张琴
王阁
肖何
黄环
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
头颈部鳞癌
EGFR单抗
肿瘤微环境
细胞亚群
摘要:
目的:利用复发和转移性头颈部鳞癌肿瘤微环境中细胞亚群特征表达基因构建抗EGFR单抗疗效预测模型.方法:通过Gene Expression Omnibus数据库搜集有抗EGFR单抗无进展生存时间( progression free survival,PFS)记录和治疗前肿瘤组织转录组微阵列芯片表达值数据集,并从文献获取肿瘤微环境细胞亚群特征表达基因.发现集中,在长PFS组和短PFS组间分析差异表达基因并计算各个细胞亚群敏感指数.最小绝对值收敛和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LOSSA)算法筛选与长PFS显著相关的细胞亚群.线性权重法构建抗EGFR单抗敏感评分(anti-EGFR antibodies sensitive score,EASS),并在独立验证集中验证.结果:在GSE65021发现集中,9个细胞亚群中计算得到EASS中位值为30. 73(范围:26. 24~41. 29),ROC曲线表明EASS可完全区别长PFS组人群与短PFS人群(AUC:1. 000,95% CI:1. 000~1. 000,P<0. 001).在GSE102995验证集中,对分期( IV vs II~III)和PS评分校正后,EASS依然是PFS的独立预后因素( HR=0. 647,95% CI:0. 503~0. 831,P=0. 001). EASS对PFS预测准确性的C指数为0. 755(95% CI:0. 719~0. 791),显著高于分期C指数0. 542(95% CI:0. 336~0. 748,P=0. 032).结论:EASS预测模型可很好地预测复发和转移性头颈部鳞癌抗EGFR抗体疗效,值得进一步研究和验证.
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篇名
肿瘤微环境细胞亚群基因标签预测复发转移性头颈鳞状细胞癌EGFR单抗疗效*
来源期刊
肿瘤预防与治疗
学科
医学
关键词
头颈部鳞癌
EGFR单抗
肿瘤微环境
细胞亚群
年,卷(期)
2019,(9)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
773-780
页数
8页
分类号
R739.8|R73-36+2
字数
4214字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-0904.2019.09.005
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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1
王阁
陆军军医大学大坪医院肿瘤中心
6
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肖何
陆军军医大学大坪医院肿瘤中心
4
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黄环
陆军军医大学大坪医院肿瘤中心
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头颈部鳞癌
EGFR单抗
肿瘤微环境
细胞亚群
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
肿瘤预防与治疗
主办单位:
四川省肿瘤医院·研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-0904
CN:
51-1703/R
开本:
16开
出版地:
成都市武侯区人民南路四段55号
邮发代号:
62-142
创刊时间:
1973
语种:
chi
出版文献量(篇)
2761
总下载数(次)
11
总被引数(次)
7663
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