iTRAQ定量蛋白质组分析中多级质谱采集策略对比分析

• 作者: 李蕾 李静宜 胡家 薛明
• 来源期刊: 山西医科大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: iTRAQ标记 二级碎裂 三级碎裂 串联质谱
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 方法与技术
• 页码范围: 1626-1630
• 页数: 5页
• 分类号: Q503
• 字数: 3291字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13753/j.issn.1007-6611.2019.11.028

摘要

目的 比较二级和三级质谱两种碎裂模式对基于同位素标记定量的蛋白质组学技术准确度的影响. 方法 采集斑马鱼在氧气浓度5％条件下,0,24,48 h取样斑马鱼脑组织蛋白样品,提取蛋白质进行iTRAQ标记,高pH值反相柱分离成15个组分,分别采用纳升液相色谱分离肽段,串级质谱(MS2)或三级质谱(MS3)两种方法碎裂肽段,利用MaxQuant定量蛋白质组分析软件,获得报告离子强度信息. 结果 MS2碎裂和MS3碎裂分别鉴定到7624个和6940个蛋白质;MS3碎裂获得的差异蛋白质数量明显多于MS2,分别为173和641个,相同的蛋白质,MS3的差异比值距离1∶1的距离更远.虽然MS3鉴定的谱图数较低,但鉴定到的肽段和蛋白质数目降低不明显. 结论 对基于iTRAQ标记的定量蛋白质组研究策略,MS3质谱分析提供更为显著的差异分析结果,是更优的选择.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李蕾	首都医科大学中心实验室	44	177	8.0	12.0
2	薛明	首都医科大学基础医学院药理学系生物医学检测技术与仪器北京实验室	57	354	10.0	16.0
3	胡家	首都医科大学中心实验室	14	23	3.0	3.0
4	李静宜	首都医科大学附属北京友谊医院北京热带医学研究所	10	33	3.0	5.0