BCG感染牛肺泡巨噬细胞的转录组测序和分析

• 作者: 吕翠萍 周彦兵 徐金瑞 杨易 王玉炯 骆佳
• 来源期刊: 吉林大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 卡介苗 牛肺泡巨噬细胞 转录组测序 长链非编码RNA
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 12-16,后插1
• 页数: 6页
• 分类号: Q939.91|R738.911
• 字数: 2769字
• 语种: 中文

摘要

目的:通过卡介苗 (BCG) 感染牛肺泡巨噬细胞 (BAM) 的转录组测序及生物信息学分析, 揭示差异表达的基因和长链非编码RNA (lncRNA) , 为巨噬细胞抗结核分枝杆菌感染的免疫调控机制研究提供理论依据.方法:采用肺脏灌洗离心法收集并培养BAM, 分为感染组和未感染组, 感染组经BCG感染后12h, 利用转录组测序技术 (RNA-Seq) 检测感染组和未感染组BAM mRNA表达谱及lncRNA表达谱, 并进行生物信息学相关分析.结果:与未感染组比较, 感染组BAM差异表达的lncRNAs共有119个 (P＜0.05) , 差异表达的mRNA共有1 111个 (P＜0.05) .在差异表达基因的功能富集分析中, 最显著富集项与免疫功能相关 (GO:0006955, P＜0.05) , 共有125个基因, 其中有63个基因表达上调, 62个基因表达下调, 且白细胞介素6 (IL-6) 、白细胞介素17 (IL-17) 和白细胞介素23A (IL-23A) 等促炎因子表达上调.lncRNA靶基因预测, 差异表达的lncRNA参与转化生长因子β (TGF-β) 信号通路及ABC转运体信号通路的调控 (P＜0.05) .结论:BCG感染BAM后, 激发宿主细胞产生强烈的免疫反应, 引起lncRNA和mRNA表达谱的改变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨易	宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	28	88	5.0	8.0
2	徐金瑞	宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	20	91	6.0	8.0
3	周彦兵	宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	3	1	1.0	1.0
4	吕翠萍	宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	2	1	1.0	1.0
5	骆佳	宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	2	1	1.0	1.0