基于SSR分子标记构建南方型美洲黑杨初级核心种质

• 作者: 张新叶 彭婵 樊孝萍 苏晓华 龙开莲
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 南方型美洲黑杨 初级核心种质 SSR
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 250-257
• 页数: 8页
• 分类号: Q346+.5|Q789
• 字数: 5652字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2019.02.0250

摘要

以所收集的363份美洲黑杨无性系为实验材料,利用20对SSR引物扩增数据,设置10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％共7个取样梯度构建南方型美洲黑杨初级核心种质,并采用平均观察等位基因数(Na)等遗传参数的t检验对核心种质有效性进行确认,以初级核心种质、保留种质以及原始种质三者之间平均观察等位基因数(Na)等遗传参数的保留比例作为评价指标,结合主坐标轴分析法对初级核心种质做进一步代表性确认.结果显示:(1)20对SSR引物共检测到278个多态位点,遗传多样性参数I、H分别为1.667和0.688 2,表明南方型美洲黑杨种质资源具有丰富的遗传变异.(2)比较平均Na、I、H变化确定15％为最佳取样比例,得到54份核心种质和309份保留种质,构建的初级核心种质与原始种质的平均Na、I、H经t检验不显着,除平均Na外其他平均遗传多样性参数,如Ne、Ho、I、H的保留率分别为111％、105％、104％和104％.(3)PCoA分析显示,所构建的初级核心种质不仅与原始种质分布相似,而且分散均匀覆盖较全面,可以代表原始种质在图中的几何分布.研究认为,所构建的45份初级核心种质保存了原始种质大部分的等位基因和基因型,剔除了原始种质的遗传冗余度和遗传重复度,具有更高的遗传多样性参数保留率,能全面代表原始种质的遗传多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张新叶	湖北省林业科学研究院湖北省速生丰产林工程技术研究中心	83	754	14.0	23.0
2	苏晓华	中国林业科学研究院林业研究所	90	2063	28.0	41.0
3	彭婵	湖北省林业科学研究院湖北省速生丰产林工程技术研究中心	26	124	6.0	9.0