泛素蛋白连接酶E3A在乳腺癌细胞中作用的蛋白质组学与生物信息学分析

• 作者: 侯令密 刘家有 李静佳 王碧娟 谢少利 赵小波 邓世山 黄红梅
• 来源期刊: 中国普通外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺肿瘤 三阴性乳腺癌 泛素蛋白连接酶类 蛋白质组学 计算生物学
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 590-596
• 页数: 7页
• 分类号: R737.9
• 字数: 4237字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7659/j.issn.1005-6947.2019.05.011

摘要

目的:通过蛋白质组学与生物信息学方法探讨泛素蛋白连接酶E3A(UBE3A)在乳腺癌细胞中的生物学功能.方法:将三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231分别转染shRNA-UBE3A片段(UBE3A敲低组)与阴性对照shRNA片段(对照组)后,采用双向电泳(2-DE)法及基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-TOF-MS/MS)对两组细胞的差异蛋白质分离和鉴定;采用DAVID Functional Annotation及String在线工具对差异表达蛋白质进行生物信息学分析.结果:2-DE及MALDI-TOF-TOF-MS/MS分离和鉴定出28个差异蛋白,其中UBE3A敲低组相对于对照组有4个表达上调,24个表达下调.与DAVID数据库有23个相匹配,其中能够进行生物学途径、细胞成分、分子功能注释分类的蛋白质分别为23个(100％)、20个(87.7％)和23个(100％),而在泛素-蛋白酶体系统及糖代谢方面分类比较明确;String分析显示这些差异蛋白中有23个存在直接或间接的联系.结论:UBE3A可能通过泛素-蛋白酶体系统功能与糖代谢途径参与乳腺癌细胞生物学行为的调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓世山	川北医学院解剖教研室	57	173	7.0	10.0
2	赵小波	川北医学院附属医院甲状腺乳腺外科	22	185	7.0	13.0
3	刘家有	川北医学院解剖教研室	7	8	2.0	2.0
4	谢少利	川北医学院附属医院甲状腺乳腺外科	16	37	2.0	5.0
5	李静佳	川北医学院解剖教研室	2	0	0.0	0.0
6	王碧娟	川北医学院第二附属医院内科	5	11	2.0	3.0
7	黄红梅	川北医学院解剖教研室	4	0	0.0	0.0