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江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析
江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析
作者:
姚学君
董梅
马永法
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
新型布尼亚病毒
全长S片段基因
分子流行病学
同源性
摘要:
目的 分析江苏省新型布尼亚病毒(SFTSV)分离株全长S片段基因的特征,为SFTSV监测和防控提供依据.方法 通过GenBank获取江苏省上传的SFTSV毒株全长S片段基因序列信息,通过构建系统进化树鉴定基因型,分析各毒株间核苷酸和氨基酸序列的同源性.结果 获取江苏省上传的35株SFTSV毒株基因信息,毒株分离年份为2010—2014年,主要为人源毒株,有28株,占80.00%.基因亚型主要为C4和C2,分别有16和14株,分别占45.71%和40.00%.35株SFTSV毒株全长S片段基因核苷酸序列同源性百分比为94.38%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.42%~100.00%;35株毒株与各亚型参考毒株间核苷酸序列同源性百分比为94.11%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.18%~100.00%;人源毒株与宿主动物分离株间核苷酸和氨基酸同源性为94.74%~99.91%和91.42%~99.80%.结论 江苏省SFTSV分离株序列间亲缘性较近,其核苷酸和氨基酸高度同源.
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文献信息
篇名
江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析
来源期刊
预防医学
学科
医学
关键词
新型布尼亚病毒
全长S片段基因
分子流行病学
同源性
年,卷(期)
2019,(1)
所属期刊栏目
疾病控制
研究方向
页码范围
65-67
页数
3页
分类号
R373
字数
1669字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1007-0931.2019.01.016
五维指标
作者信息
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马永法
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全长S片段基因
分子流行病学
同源性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
预防医学
主办单位:
浙江省预防医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1007-0931
CN:
33-1400/R
开本:
大16开
出版地:
浙江省杭州市滨江区滨盛路3399号
邮发代号:
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
11958
总下载数(次)
3
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