草原红牛FABP7基因克隆、生物信息学及组织表达差异分析

• 作者: 刘理想 吕阳 张国梁 曹阳 薛佳佳 高一
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 草原红牛 FABP7基因 生物信息学 表达差异 脂质代谢
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 48-52,57
• 页数: 6页
• 分类号: S823.2
• 字数: 4504字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.20181120-05

摘要

本研究旨在克隆草原红牛脂肪酸结合蛋白7基因(FABP7)的CDS区序列并对其进行生物信息学分析,同时检测其在牛各个组织中的mRNA表达水平.利用RT-PCR技术克隆草原红牛FABP7基因CDS区序列,并使用多种生物软件和在线工具进行生物信息学分析,通过qPCR技术检测FABP7基因在各组织间mRNA的表达水平.结果 表明:草原红牛FABP7基因CDS区全长399 bp,编码132个氨基酸,蛋白分子量为14.96 ku,理论等电点为5.38,属于亲水性蛋白;通过NCBI-BLAST对比发现,草原红牛与普通牛、羊、猪、人、鼠、鸡的核苷酸序列同源性分别为99％、98％、94％、92％、85％、85％,系统进化树结果发现,草原红牛与普通牛亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远;FABP7蛋白序列有1个二硫键,14个磷酸化位点,1个N-糖基化位点,不存在信号肽和跨膜区;在蛋白的二级结构和三级结构中发现,FABP7蛋白主要存在2个α-螺旋结构和10条β-折叠,为混合型蛋白.FABP7基因在小肠组织表达量最高,在心脏、脂肪和胃中中度表达.