2016年太原市5株人腺病毒53型病毒分离株基因特征分析

• 作者: 孟德权 宁晓玲 朱贞 李红 毛乃颖 王骥涛 许文波 赵利峰 郭建娥
• 来源期刊: 中华预防医学杂志
• 关键词: 角结膜炎 腺病毒,人 基因特征
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1271-1277
• 页数: 7页
• 字数: 4958字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2019.12.013

摘要

目的 对太原市人腺病毒53型(HAdV-53)病毒分离株进行基因特征研究.方法 采集2016年山西省眼科医院门诊流行性角膜结膜炎(EKC)病例眼结膜拭子,共计79份,通过病毒分离和3个主要衣壳蛋白基因包括五邻体基座(Penton base)、六邻体(Hexon)和纤维蛋白(Fiber)的序列鉴定,共获得5株HAdV-53病毒株,同时下载GenBank数据库中全球流行的HAdV-53病毒株以及与HAdV-53相同基因来源HAdV病毒株的相应序列,建立3个基因的数据库,分别构建系统进化树,并使用生物信息学软件分析HAdV-53基因特征和分子进化特点.结果 5株HAdV-53病毒株与1996—2014年间其他国家流行的HAdV-53病毒株在3个基因上显示了较高的一致性(>99.8%).所有HAdV-53病毒株在Penton base和Fiber基因上分别与其重组来源基因型HAdV-37和HAdV-8处于同一进化分支,在基因序列上保持了高度一致性;在Hexon基因上,与其重组来源基因型HAdV-22亲缘性关系最近,核苷酸和氨基酸序列与HAdV-22高度同源,但处于不同的进化分支,HAdV-53进化分支的进化速率为3.51×10-5替换/位点/年.结论 HAdV-53目前已成为太原市重要的新的眼部感染性病原体,HAdV-53病毒株Penton base,Hexon和Fiber基因在进化上均具有保守和稳定的特性.