食管鳞癌差异表达基因鉴定及亚洲人食管鳞癌预后lncRNA功能分析

• 作者: 任凯凯 侯明宇 刘宗文 李雨濛 蔺小艳 袁翎 马佳康 马军
• 来源期刊: 胃肠病学和肝病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: ESCC ceRNA网络 生存分析 GO及KEGG PPI
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 其他论著
• 页码范围: 532-537
• 页数: 6页
• 分类号: R735.1
• 字数: 2328字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5709.2019.05.011

摘要

目的 用生物信息学方法分析食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中转录组差异表达RNA,筛选和预测特异lncRNA的功能.方法 通过TCGA数据库筛选ESCC差异表达基因并构建相关ceRNA网络,在GEO中对差异lncRNA进行验证,并对筛选出的差异lncRNA进行生存分析.利用GO、KEGG和蛋白互作网络进一步分析与预后相关lncRNA的功能.结果 通过TCGA数据库共筛选出差异表达mRNA 2 064个,lncRNA 1 160个,miRNA 69个,并成功构建了lncRNA-miRNA-mRNA调控网络.GEO、TCGA共有差异表达lncRNA 26个,其中AC009264.1、PGM5-AS1及LINC00460与亚洲人ESCC患者生存相关.GO、KEGG、PPI分析表明这3个预后相关lncRNA可能参与ESCC的形成与进展.结论 通过分析ESCC转录组测序数据,发现一批预后相关lncRNA,有望为ESCC的治疗和预后预测提供新的靶点与分子标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马军	郑州大学消化疾病研究所	91	332	8.0	12.0
5	袁翎	河南省肿瘤医院放疗科	21	89	5.0	9.0
6	刘宗文	郑州大学第二附属医院肿瘤科	21	79	6.0	8.0
7	马佳康	郑州大学第二附属医院肿瘤科	9	9	2.0	2.0
8	任凯凯	郑州大学第二附属医院肿瘤科	8	9	2.0	2.0
9	李雨濛	郑州大学第二附属医院肿瘤科	8	31	2.0	5.0
10	蔺小艳	郑州大学第二附属医院肿瘤科	2	0	0.0	0.0
11	侯明宇	郑州大学第二附属医院肿瘤科	3	0	0.0	0.0