续随子ElPDAT1基因生物信息学及表达特性分析

• 作者: 任国鹏 唐露 孙超超 葛丽萍
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 续随子 磷脂 二酰甘油酰基转移酶1 生物信息学 实时荧光定量PCR 基因表达
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 710-714,718
• 页数: 6页
• 分类号: S565.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2019.05.03

摘要

磷脂:二酰甘油酰基转移酶1 (PDAT1)是不依赖于脂酰-CoA催化二酰甘油(DAG)合成三酰甘油(TAG)的关键酶,在种子油脂代谢过程中起关键作用.为了研究ElPDA T1基因在续随子种子油脂合成过程中的调控作用,对ElPDAT1进行了生物信息学分析,并采用qRT-PCR技术研究了该基因在续随子不同器官中的表达特性.结果 表明,ElPDA T1基因cDNA全长2968 bp,其中,开放阅读框为2 037 bp,共编码678个氨基酸,预测等电点和相对分子质量分别是5.94,75.38 ku.E1PDAT1蛋白二级结构的主要结构元件是α-螺旋(34.81％)和无规则卷曲(43.95％).ElPDA T1基因系统进化树分析表明,续随子与同科植物蓖麻、木薯、麻疯树的亲缘关系较近.qRT-PCR研究发现,ElPDA T1基因在各个器官中均有表达,且在种子中的表达量明显高于其他器官;ElPDA T1基因在种子发育中期表达量达到最大,其表达量为叶的5.82倍,说明ElPDA T1基因可能在续随子种子油脂合成过程中起调控作用.研究结果可为揭示该基因的生物学功能及全面解析续随子油脂合成机制提供科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	葛丽萍	山西农业大学林学院	9	24	2.0	4.0
2	孙超超	山西农业大学林学院	6	2	1.0	1.0
3	任国鹏	山西农业大学林学院	6	2	1.0	1.0
4	唐露	山西农业大学林学院	1	0	0.0	0.0