猪CAⅢ基因CDS区克隆、生物信息学及组织表达分析

• 作者: 乐宝玉 吴怡琦 张宁芳 成志敏 曹果清 李步高 王媛媛 王鹤洁 秦本源 蔡春波 郭晓红 高鹏飞
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 猪 CAⅢ基因 生物信息学分析 时空表达特性
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医
• 页码范围: 1069-1074,1084
• 页数: 7页
• 分类号: S828
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2019.06.32

摘要

对猪碳酸酐酶Ⅲ(Carbonic anhydraseⅢ,CAⅢ)基因进行克隆及生物信息学分析,并分析该基因的时空表达特性.通过RT-PCR和克隆测序技术获得猪CAⅢ基因的CDS序列,综合利用多种生物信息学软件,对该基因编码的蛋白质生物学特性进行预测,采用qRT-PCR技术检测CAⅢ基因的组织表达谱和时序表达规律.结果表明,猪CAⅢ基因CDS区长783 bp,编码260个氨基酸;CAⅢ 蛋白为亲水性碱性蛋白,无信号肽,主要在细胞质中发挥作用;CAⅢ基因在心脏、肝脏、胰脏、肺、胃、背最长肌、皮下脂肪、脾脏、盲肠等9种组织中均有表达,但在背最长肌中表达量最高,极显著地高于其他组织.从初生到5月龄,大白猪背最长肌中CAⅢ基因mRNA表达量呈上升—下降—上升—下降的趋势,初生时最低,随后表达量逐渐升高,到3月龄时达到峰值,之后开始下降;马身猪中,从初生到5月龄,CAⅢ基因mRNA的表达量基本呈上升趋势,在5月龄时达到峰值,极显著地高于其他各个阶段.2个不同品种相比,3月龄和4月龄时,大白猪CAⅢmRNA表达量显著或极显著地高于马身猪;而在5月龄时,马身猪CAⅢmRNA表达量极显著地高于大白猪,其他阶段2个品种CAⅢmRNA表达量无显著差异.CAⅢ基因可能直接或间接参与猪骨骼肌的生长发育过程.