扬州鹅NPFFR1基因CDS区克隆、生物信息学分析及组织表达检测

• 作者: Melak Sherif 张立凡 汪琴 陈杰 韦伟
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 扬州鹅 NPFFR1基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1-10
• 页数: 10页
• 分类号: S835
• 字数: 6155字
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在对鹅促性腺激素抑制激素受体基因(NPFFR1)进行克隆及生物信息学分析,并检测其在鹅不同组织中的表达.利用鸡NPFFR1基因为种子序列,采用RT-PCR方法克隆出扬州鹅NPRRF1基因,并通过相关软件对基因序列进行生物信息学分析.结果 显示:共发现扬州白鹅NPFFR1基因的两种剪接形式:剪接体1的ORF大小为1 200 bp,编码399个氨基酸;剪接体2的ORF大小为432 bp,编码143个氨基酸,相对剪接体1缺失31 bp.对其进行生物信息学分析发现,鹅NPFFR1基因与鸡NPFFR1基因CDS序列同源性为92.8％,其产物是一种不稳定、疏水性蛋白,主要分布在细胞膜上;蛋白质跨膜结构预测显示鹅NPFFR1蛋白含有7个跨膜结构,属于跨膜蛋白,无信号肽片段.对产蛋末期母鹅10个组织样品的cDNA实时定量PCR结果显示,NPFFR1基因在各组织中均有表达,在下丘脑中表达最高,其次是腹脂、小肠、卵巢、胃、垂体、心脏、肌肉,在肾脏以及肝脏中表达很低.研究结果为今后探究鹅NPFFR1蛋白的相关功能及与其他蛋白质的相互作用提供了理论依据,同时为扬州鹅生殖轴调控产蛋性能的机理研究提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈杰	南京农业大学动物科技学院	221	3045	31.0	44.0
2	韦伟	南京农业大学动物科技学院	4	0	0.0	0.0
3	张立凡	南京农业大学动物科技学院	2	0	0.0	0.0
4	汪琴	南京农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0
5	Melak Sherif	南京农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0