香苏杂交猪IGFBP2基因克隆、组织表达及生物信息学分析

• 作者: 蒋传美 阮涌 李吉凤 肖美美 许家利 黄家锦 许厚强 贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
• 来源期刊: 南方农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香苏杂交猪 IGFBP2基因 组织表达 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2024,（10）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 249-257
• 页数: 9页
• 语种: 中文

摘要

【目的】探究胰岛素样生长因子结合蛋白2基因（IGFBP2）在香苏杂交猪不同生长时期及组织中的表达差异，为进一步分析IGFBP2基因对香苏杂交猪生长发育分子机制提供基础数据。【方法】采用PCR扩增得到香苏杂交猪IGFBP2基因的编码区（CDS）序列，利用在线软件对IGFBP2基因的CDS序列进行生物信息学分析，利用克隆的CDS构建系统发育进化树。使用实时荧光定量PCR检测IGFBP2基因在香苏杂交猪不同阶段各组织中表达情况。【结果】猪IGFBP2基因CDS全长951 bp，共编码316个氨基酸残基，蛋白二级和三级结构以无规卷曲为主，为亲水性稳定蛋白，且IGFBP2蛋白氨基酸序列中以甘氨酸（13.0%）和亮氨酸（12.3%）为主。同源性分析发现，香苏杂交猪IGFBP2基因与野猪、牛、绵羊和山羊的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR结果显示，IGFBP2基因在3日龄、6月龄和12月龄香苏杂交猪的心脏中相对表达量存在极显著差异（P<0.01，下同），且3日龄的相对表达量较高；在肝脏中，12月龄的相对表达量显著高于3日龄和6月龄（P<0.05，下同），3日龄与6月龄无显著差异（P>0.05，下同）；在脾脏中，3日龄的相对表达量极显著高于6月龄和12月龄，12月龄的相对表达量显著高于6月龄；在肺脏中，3日龄的相对表达量极显著高于6月龄和12月龄，而6月龄与12月龄的相对表达量无显著差异；在肾脏中，3日龄、6月龄和12月龄的相对表达量间均存在显著差异；在背最长肌中，6月龄与12月龄的相对表达量存在显著差异，且IGFBP2基因在3个年龄阶段的背最长肌中的相对表达量均较低。【结论】IGFBP2基因在香苏杂交猪不同生长时期各组织中均差异表达，且在与甘油三酯和脂肪酸合成代谢相关组织（肝脏）中高特异性表达，可能表明IGFBP2基因对脂肪的合成、代谢和沉积具有重要调控作用。