人体心肌内和血液中衰老相关长链非编码RNA的综合分析

• 作者: 田佳瑜 程子超 范谦 赵锦阳
• 来源期刊: 中国医药
• 学科: 医学
• 关键词: 衰老 长链非编码RNA mRNA 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 673-676
• 页数: 4页
• 分类号: R363.2
• 字数: 4023字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j.issn.1673-4777.2019.05.008

摘要

目的 探讨人类心肌和血液标本中长链非编码RNA(lncRNA) 和mRNA的表达谱,分析人体心肌和血液标本中富集的与衰老相关的lncRNA,预测其潜在生物学功能和通路.方法 对19对祖孙(老年组和青年组) 的38份血液样本和7例接受心脏手术患者的心肌组织进行lncRNA和mRNA基因微阵列分析,筛选老年组和青年组血液标本差异性表达的lncRNA和mRNA,对血液样本中的差异基因、血液样本中富集的基因及心肌组织样本中富集的基因求交集并绘制Venn图,对筛选出的心肌衰老相关的差异基因进行通路分析,利用共表达网络分析筛选出起核心作用的mRNA和lncRNA,并推测哪些mRNA和lncRNA之间具有调控关系.结果 在人类心肌标本中共检测到75 434个lncRNA和20 666个mRNA,在人类血液标本中共检测到75 434个lncRNA及20 666个mRNA,其中老年组与青年组差异性表达的lncRNA 2 835个,差异性表达的mRNA 959个.筛选血液标本中富集的lncRNA共24 281个、心肌标本中富集的lncRNA共23 980个与血液标本中具有衰老差异的lncRNA的交集,共得到可代表与心肌衰老相关的差异lncRNA720个; 筛选血液标本中富集的5 554个mRNA、心肌标本中富集的4 520个mRNA与血液标本中具有衰老相关差异的959个mRNA的交集,共得到可以代表与心肌衰老相关的差异mRNA 63个.通过共表达网络图辅助发现lncRNA与mRNA之间可能存在的作用关系,找到影响mRNA表达的lncRNA,有助于发现网络中起中心调控作用的lncRNA及其可能存在的新作用机制.结论 基因微阵列分析人类心肌和血液中lncRNA的表达谱,并对其进行潜在功能及通路的预测和分析,可为未来lncRNA和心肌衰老的相关研究提供参考及帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范谦	首都医科大学附属北京安贞医院心内科北京市心肺血管疾病研究所	30	171	7.0	11.0
2	程子超	首都医科大学附属北京安贞医院心内科北京市心肺血管疾病研究所	3	2	1.0	1.0
3	赵锦阳	首都医科大学附属北京安贞医院心内科北京市心肺血管疾病研究所	2	0	0.0	0.0
4	田佳瑜	首都医科大学附属北京安贞医院心内科北京市心肺血管疾病研究所	1	0	0.0	0.0