心源性脑卒中患者超急性期外周血miRNA与mRNA整合研究

• 作者: 冯品 周搏 王新 郭晓玲
• 来源期刊: 中国保健营养
• 关键词: 心源性脑卒中 miRNA mRNA 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（17）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 38-39
• 页数: 2页
• 字数: 2909字
• 语种: 中文

摘要

目的:整合分析心源性脑卒中超急性期外周血miRNA与mRNA数据,探讨二者相互作用关系及生物学功能.方法:GEO数据库中收集心源性脑卒中患者超急性期外周血miRNA与mRNA数据.通过GEO2R筛选差异表达的miRNA和mRNA.应用miRWalk、TargetScan、miRBD数据库预测miRNA可能的靶mRNA,共同的靶mRNA与GEO数据库筛选出的mRNA相交获取相关的mRNA作为心源性脑卒中mRNA(Cardioembolic-mRNA,CE-mRNA),构建miRNA和CE-mRNA交互网络,通过GO和KEGG功能富集分析探讨CE-mRNA的生物学功能.结果:相比对照组,心源性脑卒中超急性期外周血28种miRNA表达上调,2种miRNA下调,此外有631种mRNA差异表达.筛选出23个CE-mRNA,其中miR-106b-5 p,miR-30d-5 p,miR-223-3p,miR-26 a-5 p与CE-mRNA存在广泛的相互作用关系,GO和KEGG分析表明CE-mRNA在IL-6介导的信号通路、JAK-STAT介导的生长激素信号通路级联反应、运动神经元轴突导向通路中被富集.结论:本研究筛选出心源性脑卒中患者超急性期特征性的miRNA和mRNA,构建了CE-miRNA-mRNA的共表达网络,网络中的基因显著富集在炎症反应、信号传递和轴突延伸等病理生理过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭晓玲		38	89	7.0	8.0
2	冯品		3	0	0.0	0.0
3	周搏		3	2	1.0	1.0
4	王新		2	0	0.0	0.0