运用TCGA分析胰腺癌患者差异表达miRNAs及其靶基因预测

• 作者: 侯晓丽 张荣花 熊亚南 王梅梅 王源 章广玲 苏静慧
• 来源期刊: 世界最新医学信息文摘（连续型电子期刊）
• 学科: 医学
• 关键词: TCGA 差异表达miRNAs 靶基因预测 数据筛选
• 年，卷（期）: 2019,（71）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 38-43
• 页数: 6页
• 分类号: R596.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.19613/j.cnki.1671-3141.2019.71.018

摘要

目的 探讨应用TCGA数据库筛选胰腺癌患者差异表达的miRNAs,运用生物信息学预测其相关靶基因.方法 应用R语言筛选与正常胰腺组织相比差异表达的miRNAs,TCGA数据库下载胰腺癌miRNA_HiSeq_gene资料包,运用Microsoft O?ce Excel软件对数据包分析处理,应用GraphPad Prism 6绘制胰腺癌患者miRNAs差异表达、临床分期,Kaplan-Meier生存曲线,使用生物信息学网站预测其相关靶基因.结果筛选出hsa-miR-192-5p、hsa-miR-203a-3p和hsa-miR-451a在胰腺癌患者有明显差异表达(P<0.05),MCM4、REV3L、ZBTB4为hsa-miR-192-5p的靶基因,ZNF148、TMEM69为hsa-miR-203a-3p的靶基因,EREG为hsa-miR-451a靶基因.结论 差异表达的 miRNAs 和靶基因对胰腺癌的诊断和预后有重要影响,可以作为肿瘤生物标志物对其进行进一步研究,对癌症前期预防及诊疗提供了有力的依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	熊亚南		6	1	1.0	1.0
2	章广玲		12	24	4.0	4.0
3	侯晓丽		6	9	2.0	3.0
4	张荣花		4	4	1.0	2.0
5	王梅梅		3	0	0.0	0.0
6	王源		2	0	0.0	0.0
7	苏静慧		1	0	0.0	0.0