引起导管相关血流感染的草螺菌属Herbaspirillum huttiense鉴定及药敏分析

• 作者: 周芳 杨彪 林丽 王前 肇恒瑞 胡秀梅 芮勇宇 苏冰 郑磊 陈晶
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 关键词: 导管相关性感染 菌血症 草螺菌属 基因组,细菌 高通量核苷酸序列分析 微生物敏感性试验
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 582-586
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20190918-00542

摘要

目的 分析导管相关性血流感染草螺菌属的鉴定和药敏试验过程,提高临床医师和微生物检验工作者对罕见病原微生物关注和认知.方法 采集1例慢性肾衰竭血液透析患者经透析导管留取的血培养阳性标本,涂片、染色、镜检,并对分离到单个菌落,分别进行质谱分析、生化鉴定和药敏试验;提取细菌基因组DNA,扩增细菌16S rDNA并测序;细菌基因组高通量测序.结果 血培养瓶孵育20 h后阳性报警,涂片见革兰阴性杆菌.血琼脂上孵育16h,见乳白色、凸起和无溶血菌落.VITEK2 Compact鉴定为洋葱伯克霍尔德菌,N335药敏卡检测药敏结果,发现该菌对氨曲南和多黏菌素耐药,其余抗生素均敏感.VITEK MS质谱仪临床数据库无法鉴定出种属,VITEK MS科研数据库鉴定为Herbaspirillum huttiense/Herbaspirillum aquaticum.该菌16S rDNA与草螺菌属Herbaspirillum huttiense、Herbaspirillum aquaticum一致性均＞99％.细菌基因组高通量测序,发现本例临床分离株与Genbank数据库中Herbaspirillum huttiense subsp putei IAM 15032同源性为100％,证实本例分离株为Herbaspirillum huttiense.结论 环境微生物演变成人类病原菌种类不断增多,草螺菌属因其生化特性与其他菌种相似,极易被误鉴定,需引起检验工作者的重视.