花生幼苗响应低温胁迫的转录组分析

• 作者: 于海秋 任婧瑶 史晓龙 张鹤 董佳乐 蒋春姬 赵新华
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 花生 低温胁迫 基因表达 转录组
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 96-104
• 页数: 9页
• 分类号: S565.2
• 字数: 6123字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1700.2020.01.011

摘要

低温冷害是限制我国东北地区花生产量和品质提升的主要环境因素,鉴定花生耐寒的关键功能基因,并揭示其调控机制是创制耐寒花生种质,提高花生耐冷性的重要途径之一.以耐寒型花生品种农花5号为试验材料,对6℃低温胁迫下的花生叶片进行RNA-Seq转录组测序分析.结果表明:与对照相比,共有3910个基因持续差异表达;GO功能注释将差异表达基因富集到43个功能组,其中生物学过程中的代谢过程富集到的基因数目最多;KEGG代谢通路分析将持续差异表达基因富集到116个代谢通路中,其中植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢、植物-病原菌互作、植物昼夜节律和α-亚麻酸代谢途径富集到的基因数目最多,且大部分为上调表达,在低温胁迫中具有重要作用.从转录组数据库中随机挑选6个差异表达基因进行qRT-PCR验证,其表达趋势与高通量测序结果相一致,证明了转录组数据的可靠性.研究结果将为揭示花生响应低温胁迫的分于机制提供理论依据.