陆地棉幼苗NaCl胁迫下转录因子的转录组学分析

• 作者: 彭振 何守朴 龚文芳 潘兆娥 贾银华 卢艳丽 杜雄明
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 陆地棉 NaCl胁迫 转录组分析 转录因子
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 354-370
• 页数: 16页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.00354

摘要

以棉花耐盐种质早熟长绒7号和感盐种质南丹巴地大花为材料，利用转录组测序(RNA-Seq)技术分析2个种质在200mmolL–1NaCl胁迫4h和24h后幼苗叶片的转录因子家族及转录因子的表达情况。结果表明，从样本中鉴定出54个转录因子家族的2815个转录因子。盐胁迫4h后，长绒7号有249个转录因子基因表达发生变化;南丹巴地大花中有261个转录因子基因表达发生变化。在胁迫24h后，2个种质对盐响应的转录因子数量均剧增。只在耐盐种质长绒7号特异表达的有106个(4h)和184个(24h)转录因子基因，对于2个种质共同表达的转录因子有143个(4h)和282个(24h)。通过筛选，鉴定出26个与耐盐相关的转录因子家族124个转录因子基因，并采用荧光定量验证转录组数据的准确性。推测高表达的11个转录因子的基因CotAD_66280(HD-ZIP)、CotAD_47058(ERF)、CotAD_18472(G2-like)、CotAD_04289(C2H2)、CotAD_57763(HSF)、CotAD_23656(TCP)、CotAD_02221(ERF)、CotAD_23975(WRKY)、CotAD_54036(MYB)、CotAD_27788(NAC)和CotAD_23815(HSF)有可能与陆地棉抗盐性密切相关，可作为陆地棉耐盐育种的候选基因源。