蕨类植物叶绿体rps12基因的分子进化研究

• 作者: 平晶耀 王艇 祝铭 苏应娟
• 来源期刊: 植物科学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蕨类植物 叶绿体 IR区 rps12基因 进化速率 GC含量 适应性进化
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 系统与进化
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: Q949.36
• 语种: 中文
• DOI: 10.11913/PSJ.2095-0837.2020.10001

摘要

以68种蕨类植物和2种石松类植物的rps12基因为对象,在系统发育背景下,结合最大似然法,使用HyPhy和PAML软件对该基因进行进化速率和适应性进化研究.结果显示:位于IR区的外显子2～3,其替换率明显降低,rps12基因编码序列的替换率也随之降低,且rps12基因密码子第3位的GC含量明显升高;在蕨类植物的进化过程中,3'-rps12更倾向定位于IR区,以保持较低的替换率;rps12基因编码的123个氨基酸位点中,共检测到4个正选择位点和116个负选择位点.研究结果表明基因序列进入到IR区后,显示出降低的替换率;强烈的负选择压力表明RPS12蛋白的高度保守性以及rps12基因的功能和结构已经趋于稳定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏应娟	中山大学生命科学学院	48	804	18.0	27.0
5	王艇	华南农业大学生命科学学院	6	4	1.0	2.0
7	平晶耀	华南农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
8	祝铭	华南农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0