大花铁线莲单重被花的转录组差异分析

• 作者: 周安龙 熊阳阳 王锦 罗琳莉 赵士豪
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 大花铁线莲 单重被花 高通量测序 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 93-105
• 页数: 13页
• 分类号: S68
• 字数: 7330字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2020.01.014

摘要

以即可开单被花又可开重被花的大花铁线莲重被品种“薇安”为研究对象,对“薇安”同一时期同一植株上的3种不同花瓣类型(单被、半重被、重被)采用高通量测序技术进行拼接及功能注释,筛选不同花被类型下表 达量高度差异的关键基因后进行实时荧光定量PCR验证.结果 显示:转录组测序共产生13.8GB原始数据,3个转录本文库两两比较共获得3 075条差异表达基因(DEG),其中单被花与半重被样本对比(A vs B)包括649条上调DEG,605条下调DEG;半重被花与重被花对比(B vs C)包括上调DEG 1 046条和下调DEG 721条;单被花与重被花对比(A vs C)有上调DEG 1 129条和下调DEG 859条.3个不同花被下共存的差异表达基因有134条.根据基因功能注释从总DEG中筛选出26条可能与重瓣化性状相关的基因进行聚类分析,并随机挑选10个目的基因进行荧光定量PCR验证.PCR结果显示这些基因的表达量在铁线莲“薇安”同一时期同一植株的3种花被类型中均存在显著差异.最终筛选出与铁线莲重瓣化相关的关键基因有MADS-BOX类基因PMADS1、AP3、FRUIT-FULL、FLC;生长素反应蛋白IAA9、生长素输入载体、脱落酸8’羟化酶、吲哚乙酸诱导蛋白ARG7等.本研究为探究铁线莲重瓣花分子机制提供了基础数据和理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王锦	西南林业大学园林学院	46	187	7.0	11.0
2	熊阳阳	西南林业大学园林学院	7	7	2.0	2.0
3	罗琳莉	西南林业大学园林学院	4	2	1.0	1.0
4	赵士豪	西南林业大学园林学院	2	2	1.0	1.0
5	周安龙	西南林业大学园林学院	1	0	0.0	0.0