基于条件关联互补基因的乳腺癌预后分析

• 作者: 张屹 张成 王冠方 闫双双 韩珊珊 黄海云
• 来源期刊: 河北科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物数学 乳腺癌 条件关联基因 预后模型 临床预测
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 食品与生物科学
• 页码范围: 349-355
• 页数: 7页
• 分类号: Q786
• 字数: 5667字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7535/hbkd.2020yx04008

摘要

为了提高乳腺癌患者的生存率,改善病人的临床治疗效果,从分子机制上研究了乳腺癌的致病基因.首先对113个正常组织和1109个癌症组织的表达量进行差异分析,然后对差异表达的基因采用条件联合分析方式对互补基因进行分组,并用逐步Cox回归挑选出一组基因拟合预后模型.研究结果显示:VWCE,SPDYC,CRYBG 3,DEFB 1,SEL 1L 2,NMNAT 26个基因对患者生存率是有害的,AMZ 1,GJ B 2,CXCL 2,ALDOC 4个基因对患者生存率是有利的,最终确定10个基因的预后模型能够显著地将样本分为高风险组和低风险组,并且对乳腺癌患者5年和10年的生存率进行了预测,依赖时间的AUC值均可达0.7以上.所提方法能够利用基因与基因之间的关联性,很好地对高维数据进行降维,消除基因与基因之间的共线性问题,10个基因的预后模型可以对患者的临床预测提供帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张屹	河北科技大学理学院	7	13	2.0	3.0
2	闫双双	河北科技大学理学院	2	0	0.0	0.0
3	张成	河北科技大学信息科学与工程学院	3	0	0.0	0.0
4	王冠方	河北科技大学理学院	1	0	0.0	0.0