免疫相关LncRNA与膀胱癌预后关系分析及预测模型建立

• 作者: 周旻 柳子川 游华 王尧
• 来源期刊: 遵义医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 膀胱癌 LncRNA 免疫治疗 基因表达谱 预测模型
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 临床医学研究
• 页码范围: 76-80
• 页数: 5页
• 分类号: R737.14
• 字数: 2932字
• 语种: 中文

摘要

目的 分析免疫相关LncRNA与膀胱癌预后的关系,建立预测模型并初步探讨各组免疫特征.方法 从TCGA数据库下载393例膀胱癌患者的基因表达谱及相应预后信息,通过R和Perl软件分析处理数据并提取免疫相关LncRNA;应用COX风险比例回归模型分析预后相关LncRNA并在此基础上构建预测模型,采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并对组间差异进行log-rank检验;通过ROC曲线下面积(AUC)评价模型的预测准确度;采用主成分分析(PCA)及基因富集分析(GSEA)各组中免疫相关基因的分布,采用ESTIMATE法评估各样本免疫微环境的组成.结果 通过单因素及多因素COX回归分析确定5个免疫相关LncRNA,根据回归系数β对其赋值并计算患者评分,构建预测模型并分为高风险组和低风险组,两组的生存期具有明显统计学差异(P＜0.001);预测模型ROC曲线下面积AUC:0.69;高、低风险组患者免疫相关基因分布具有明显的差异,且高风险组免疫评分较高.结论 基于免疫相关LncRNA构建的模型能够较好的预测膀胱癌患者的生存及免疫状态,有助于临床上进行预后判断及分层个体化治疗.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柳子川	广州医科大学附属肿瘤医院内科	13	38	2.0	6.0
2	王尧	广州医科大学附属肿瘤医院内科	8	1	1.0	1.0
3	周旻	广州医科大学附属肿瘤医院内科	10	7	2.0	2.0
4	游华	广州医科大学附属肿瘤医院内科	1	0	0.0	0.0