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EZH2和VEGF在结直肠癌中的表达其与患者预后关系生物信学分析及验证
EZH2和VEGF在结直肠癌中的表达其与患者预后关系生物信学分析及验证
作者:
于立刚
毛国良
陈素琴
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肠癌
EZH2基因
VEGF基因
预后
免疫组化
摘要:
背景结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)是临床上常见的消化系统恶性肿瘤.但其确切发病机制和预后独立因素仍未阐明.本研究通过生物信息学方法分析了zeste基因增强子同源物2(enhancer of zeste homolog 2,ZEH2)和血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)基因在CRC中的表达情况及其和患者预后的感谢.并采用免疫组化检测了EZHE2和VEGF蛋白的表达情况及其与患者临床特征的关系.目的探讨EZH2和VEGF在CRC中的表达、突变情况及其与患者临床病理特征和预后的关系.方法首先在TCGA数据库中比较ZH2和VEGF基因mRNA在肠癌患者癌和癌旁组织中的表达,同时分析EZH2和VEGF基因的突变情况;采用STRING数据库建立EZH2和VEGF基因表达网络并筛选网络中的关键基因.根据EZH2和VEGF在肿瘤组织中的表达分为高低表达组,Cox回归模型Log-rank检验比较高低表达组患者总生存和无疾病进展生存是否存在差异.同时选取80例肠癌手术患者,留取患者癌组织和癌旁组织,采用免疫组织化学法检测上述组织中EZH2和VEGF蛋白表达水平.结果TCGA数据库显示EZH2和VEGF基因在CRC组织中的表达水平显著高于对应的正常肠上皮组织(P<0.05),而与肠癌患者的临床分期并无明显相关性(P>0.05);EZH2和VEGF基因在人肠癌中的突变率分别为1.5%和1.9%,且EZH2和VEGF不同突变组织中mRNA表达水平存在明显差异.网络中共有22个蛋白,各蛋白平均相互作用指数为10.5,区域聚集指数为0.8,各蛋白富集明显(P<0.0l).Cytohubb软件筛选出EZH2,DNMT1,HDAC2,YY1和SUZ12为网络中的关键基因;EZH2和VEGF高低表达与患者总生存期均无相关性(P>0.05),而VEGF高表达组患者无痰病进展生存期显著低于低表达组(HR=1.8,P<0.05).免疫组化显示,EZH2和VEGF在肠癌组织中的阳性表达率均显著高于癌旁组织(P<0.01).EZH2阳性表达与肠癌肿瘤直径、分化程度和Duke分期有关(P<0.05).而VEGF阳性表达与肠癌患者分化程度和Duke分期存在相关性(P<0.05).结论EZH2和VEGF在肠癌组织中呈现明显上调表达和突变,其高表达与肿瘤大小、分会程度和Duke分期有关,并可作为肠癌预后的潜在分子标志物.
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篇名
EZH2和VEGF在结直肠癌中的表达其与患者预后关系生物信学分析及验证
来源期刊
世界华人消化杂志
学科
关键词
肠癌
EZH2基因
VEGF基因
预后
免疫组化
年,卷(期)
2020,(5)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
155-166
页数
12页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11569/wcjd.v28.i5.155
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引文网络
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
世界华人消化杂志
主办单位:
太原消化病研治中心
出版周期:
旬刊
ISSN:
1009-3079
CN:
14-1260/R
开本:
大16开
出版地:
社址:山西省太原市双塔西街77号;办公地址:北京市朝阳区东四环中路62号,远洋国际中心D座903室
邮发代号:
22-117
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
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总下载数(次)
16
总被引数(次)
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