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摘要:
[目的]探讨三叶糖脂清片治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制.[方法]使用网络检索平台中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)的SYSDT运算确定三叶糖脂清的有效活性成分与相关靶点信息,使用Perl语言并结合Uniprot数据库,最终得到三叶糖脂清的基因靶点缩写.利用人类表型本体论(HPO)数据库和Genecard数据库检索T2DM相关靶基因.使用STRING数据库分析并结合Cytoscape 3.7.1软件绘制靶点蛋白互作网络(PPI),借助Perl语言转换为基因编号,利用R语言的Bioconducor程序包进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因功能分析(GO)富集分析.探讨三叶糖脂清的多重药理作用机制,为下一步实验验证奠定基础.[结果]通过网络参数分析确定了三叶糖脂清含有80个活性成分,对应82个生物靶点.通过Genecard和HPO数据库得到540个T2DM靶点,其中Genecard数据库中选取Score值大于30的靶点.两者对比提取重叠靶点,并与80个活性成分构建出"活性成分-靶点"网络.揭示了三叶糖脂清活性成分与T2DM靶点之间的相互作用,并对重叠靶点的蛋白互作网络(PPI)进行分析,明确药物影响疾病的关键靶点.此外,对重叠靶点进行KEGG通路富集分析和GO功能富集分析,探索了三叶糖脂清治疗T2DM的作用机制.[结论]三叶糖脂清治疗T2DM具有多成分、多靶点、多途径的特点,为进一步开展三叶糖脂清抗T2DM作用的分子机制研究提供了新思路和科学依据.
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文献信息
篇名 基于网络药理学探讨三叶糖脂清治疗2型糖尿病的作用机制
来源期刊 天津中医药 学科 医学
关键词 三叶糖脂清 2型糖尿病 网络药理学 KEGG通路富集 潜在靶点
年,卷(期) 2020,(4) 所属期刊栏目 中药研究
研究方向 页码范围 462-468
页数 7页 分类号 R587.1
字数 3484字 语种 中文
DOI 10.11656/j.issn.1672-1519.2020.04.23
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张晗 天津中医药大学中医药研究院 47 405 11.0 19.0
2 李霖 天津中医药大学中医药研究院 14 37 4.0 5.0
3 晏一淇 天津中医药大学中医药研究院 3 0 0.0 0.0
4 黄明 天津中医药大学中医药研究院 13 34 4.0 5.0
5 于亚君 天津中医药大学中医药研究院 2 0 0.0 0.0
6 胡珍 4 49 3.0 4.0
7 韩国英 天津中医药大学中医药研究院 1 0 0.0 0.0
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三叶糖脂清
2型糖尿病
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KEGG通路富集
潜在靶点
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天津中医药
月刊
1672-1519
12-1349/R
大16开
天津市南开区鞍山西道312号
6-83
1984
chi
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