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基于网络药理学探讨三叶糖脂清治疗2型糖尿病的作用机制
基于网络药理学探讨三叶糖脂清治疗2型糖尿病的作用机制
作者:
于亚君
张晗
晏一淇
李霖
胡珍
韩国英
黄明
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
三叶糖脂清
2型糖尿病
网络药理学
KEGG通路富集
潜在靶点
摘要:
[目的]探讨三叶糖脂清片治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制.[方法]使用网络检索平台中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)的SYSDT运算确定三叶糖脂清的有效活性成分与相关靶点信息,使用Perl语言并结合Uniprot数据库,最终得到三叶糖脂清的基因靶点缩写.利用人类表型本体论(HPO)数据库和Genecard数据库检索T2DM相关靶基因.使用STRING数据库分析并结合Cytoscape 3.7.1软件绘制靶点蛋白互作网络(PPI),借助Perl语言转换为基因编号,利用R语言的Bioconducor程序包进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因功能分析(GO)富集分析.探讨三叶糖脂清的多重药理作用机制,为下一步实验验证奠定基础.[结果]通过网络参数分析确定了三叶糖脂清含有80个活性成分,对应82个生物靶点.通过Genecard和HPO数据库得到540个T2DM靶点,其中Genecard数据库中选取Score值大于30的靶点.两者对比提取重叠靶点,并与80个活性成分构建出"活性成分-靶点"网络.揭示了三叶糖脂清活性成分与T2DM靶点之间的相互作用,并对重叠靶点的蛋白互作网络(PPI)进行分析,明确药物影响疾病的关键靶点.此外,对重叠靶点进行KEGG通路富集分析和GO功能富集分析,探索了三叶糖脂清治疗T2DM的作用机制.[结论]三叶糖脂清治疗T2DM具有多成分、多靶点、多途径的特点,为进一步开展三叶糖脂清抗T2DM作用的分子机制研究提供了新思路和科学依据.
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文献信息
篇名
基于网络药理学探讨三叶糖脂清治疗2型糖尿病的作用机制
来源期刊
天津中医药
学科
医学
关键词
三叶糖脂清
2型糖尿病
网络药理学
KEGG通路富集
潜在靶点
年,卷(期)
2020,(4)
所属期刊栏目
中药研究
研究方向
页码范围
462-468
页数
7页
分类号
R587.1
字数
3484字
语种
中文
DOI
10.11656/j.issn.1672-1519.2020.04.23
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
张晗
天津中医药大学中医药研究院
47
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李霖
天津中医药大学中医药研究院
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晏一淇
天津中医药大学中医药研究院
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黄明
天津中医药大学中医药研究院
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于亚君
天津中医药大学中医药研究院
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胡珍
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韩国英
天津中医药大学中医药研究院
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引文网络
引文网络
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2型糖尿病
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研究去脉
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天津中医药
主办单位:
天津市中医药大学
天津中西医结合学会
天津中医药学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-1519
CN:
12-1349/R
开本:
大16开
出版地:
天津市南开区鞍山西道312号
邮发代号:
6-83
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
5563
总下载数(次)
4
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