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水稻苗期耐冷性差异的转录组分析
水稻苗期耐冷性差异的转录组分析
作者:
孙平勇
张宏伟
李树杏
邓华凤
郝留根
郭慧
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
水稻
转录组
低温胁迫
差异表达基因
摘要:
低温冷害是影响作物生长发育的重要环境因素之一.鉴定水稻耐冷新基因以及揭示其可能的机制并应用于新种质创制和新品种选育,是提高水稻耐冷性的重要途径之一.本研究以日本晴(Nip)为对照,对耐冷品种P427的表型和扫描电镜表皮组织观察,显示P427具有更强的苗期耐冷性.进而对低温处理后的水稻幼苗转录组进行测序,结果显示P427与Nip共有12 056个差异表达基因(DEGs),P427独有2 984个DEGs.对DEGs进行Pathway显著性富集分析发现,P427和Nip共有的DEGs主要富集在代谢途径、次生代谢物的生物合成等途径.而P427独有的DEGs主要集中在泛素介导的蛋白水解、内质网中的蛋白质加工、植物激素信号转导等途径.结果 暗示激素信号转导、苯丙氨酸代谢通路、光合作用、次生代谢生物合成等途径可能在水稻苗期冷胁迫响应中起主导作用.植物对低温的响应是涉及多个基因和多个信号传导途径的复杂过程,本研究扩展了对植物低温冷害耐受性的复杂机制的理解,为今后开展水稻和其他谷类作物的耐冷性研究提供了理论依据.
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苗期
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研究进展
水稻苗期耐冷性研究进展
水稻
苗期
耐冷性
鉴定
数量性状位点(QTLs)
基于比较转录组的水稻苗期耐冷相关基因BGIOSGA032296 TALEN基因组编辑技术构建
比较转录组
东乡野生稻
TALEN基因组编辑技术
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
水稻苗期耐冷性差异的转录组分析
来源期刊
分子植物育种
学科
关键词
水稻
转录组
低温胁迫
差异表达基因
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
基因组学及功能基因
研究方向
页码范围
1731-1739
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13271/j.mpb.018.001731
五维指标
传播情况
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引文网络
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转录组
低温胁迫
差异表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
分子植物育种
主办单位:
海南省生物工程协会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1672-416X
CN:
46-1068/S
开本:
大16开
出版地:
海南省海口市海秀大道128号双岛公寓13B室
邮发代号:
84-23
创刊时间:
2003
语种:
chi
出版文献量(篇)
7272
总下载数(次)
34
总被引数(次)
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