基于非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的菜心SCoT分析

• 作者: 史卫东 康红卫 张力 琚茜茜 罗海玲
• 来源期刊: 亚热带植物科学
• 关键词: 菜心 抗虫性 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 SCoT分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 植物分子生物学
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: S634
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-7791.2020.01.001

摘要

以菜心(Brassica rapa var.parachinensis)抗小菜蛾品种Caixin65和感小菜蛾品种Caixin69及6份F2株系为材料,利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测菜心抗虫株系的SCoT多态性,同时进行SCoT多态性的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测效率、遗传多样性分析和差异条带克隆分析.结果表明,非变性聚丙烯酰胺凝胶能检测出亲本与子代间的SCoT多态性和遗传多样性变化,条带数量较多且清晰,提高了SCoT标记检测效率.选取亲本的10条非变性聚丙烯酰胺凝胶差异片段克隆测序,获得感虫序列4条、抗虫序列6条,GENSCAN预测其中8条具有启动子、终止子、阅读框等基因结构序列.同源性检索分析表明,感虫序列分别与泛素羧基末端水解酶mRNA序列、大白菜克隆序列、白菜线粒体丙酮酸载体蛋白序列、甘蓝基因组编码未知蛋白的HDEM序列同源,抗虫序列分别与白菜RNA假尿苷合酶4线粒体mRNA序列、京水菜线粒体DNA序列、白菜未知蛋白mRNA序列、白菜4-香豆酸:辅酶A连接酶mRNA序列、大白菜克隆序列、哈茨木霉mRNA序列同源.本研究提高了SCoT标记清晰度、遗传多样性检测水平和差异片段克隆的精准性,使得SCoT成为批量克隆差异片段的高效工具,有助于挖掘SCoT功能性标记信息,开展初步的功能基因组学研究,提高优异株系筛选鉴定效率,加快育种进程,为菜心抗虫性机制的进一步研究提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	史卫东	广西农业科学院蔬菜研究所	8	28	4.0	5.0
2	琚茜茜	广西农业科学院蔬菜研究所	5	6	2.0	2.0
3	张力	广西农业科学院蔬菜研究所	8	16	3.0	4.0
4	罗海玲	广西农业科学院蔬菜研究所	22	198	8.0	13.0
5	康红卫	广西农业科学院蔬菜研究所	22	75	4.0	7.0