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提高开放性检索鉴定灵敏度的互补离子谱图策略
提高开放性检索鉴定灵敏度的互补离子谱图策略
作者:
刘璐瑶
叶明亮
毛家维
王科云
秦洪强
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
蛋白质组学
开放式检索
互补离子谱图
鉴定灵敏度
摘要:
开放性检索通过放宽母离子质量偏差容忍度可实现一定质量偏差范围内所有修饰的鉴定.由于开放性检索完全依赖于肽段子离子的匹配而基本忽略谱图母离子的质量限制,使其区分正反库肽段的能力低于限制性检索.因此,开放性检索更依赖于二级谱精度.二级谱的质量精度越低,开放性检索的肽段鉴定灵敏度越低.互补离子谱图是由原谱图谱峰的互补离子组成的.原谱图和互补离子谱图随机匹配到相同反库肽段的概率远低于它们同时匹配到正库肽段的概率,以原谱图和互补离子谱图鉴定到相同肽段序列作为过滤条件,可以过滤掉80%以上的假阳性鉴定结果,从而在指定的假阳性率下显著地提高了开放性检索的肽段鉴定灵敏度.本方法在0.5u子离子质量误差容忍度下,相对常规开放性检索谱图鉴定量提高了116%,肽段序列鉴定量提高了97%.
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文献信息
篇名
提高开放性检索鉴定灵敏度的互补离子谱图策略
来源期刊
质谱学报
学科
化学
关键词
蛋白质组学
开放式检索
互补离子谱图
鉴定灵敏度
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
11-18
页数
8页
分类号
O657.63
字数
5123字
语种
中文
DOI
10.7538/zpxb.2018.0155
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
叶明亮
中国科学院大连化学物理研究所
20
82
5.0
8.0
2
秦洪强
中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析化学重点实验室
5
5
1.0
2.0
3
毛家维
中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析化学重点实验室
1
0
0.0
0.0
7
王科云
中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析化学重点实验室
1
0
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8
刘璐瑶
中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析化学重点实验室
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同被引文献
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参考文献(2)
二级参考文献(0)
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参考文献(2)
二级参考文献(0)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
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引证文献(0)
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蛋白质组学
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互补离子谱图
鉴定灵敏度
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
质谱学报
主办单位:
北京中科科仪技术发展有限责任公司
中国物理学会质谱分会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-2997
CN:
11-2979/TH
开本:
大16开
出版地:
北京275信箱65分箱中国原子能科学研究院
邮发代号:
82-349
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
1837
总下载数(次)
1
总被引数(次)
12922
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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