湿地土壤元素的空间分布受到多种环境因素的影响,其中水文条件通过水文周期的变化以及地表水和地下水的运动对土壤元素进行调节.洞庭湖湿地生态系统观测研究站自2009年正式运行以来,按中国生态系统研究网络(Chinese Ecosystem Research Network,CERN)统一的监测规范,对洞庭湖水文情势变化下,湿地生态系统中土壤主要理化性质、营养元素、重金属含量等指标进行长期定位监测.通过洞庭湖三种典型湿地植物(苔草,荻和辣蓼)样地表层土壤元素监测数据进行加工处理,获得2012-2016年洞庭湖洲滩土壤元素含量数据集.本数据集包含有机质、全氮、全磷、全钾、有效磷、速效钾、全锰、全铁、铅、铬、镍、汞、砷13个指标.13个指标测定的相对误差平均为4.24%,重复测定的相对偏差为3.76%.同时附有完整的背景信息,保证了数据在空间和时间上的一致性.本数据集可以为洞庭湖土壤营养状况评估、环境质量评估、土壤污染风险评价以及环境土壤学研究等工作提供数据基础.