索拉菲尼诱导的肝癌耐药细胞株的建立及基因表达分析

• 作者: 丁慧荣 刘月香 张宏 曲莉 田志华 马博
• 来源期刊: 北京大学学报医学版
• 关键词: 肝细胞癌 索拉菲尼耐药 TCGA CBX4
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 207-213
• 页数: 7页
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.19723/j.issn.1671-167X.2020.02.003

摘要

目的:建立索拉菲尼诱导的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)耐药细胞株,筛选出耐药细胞株中的高表达基因,进一步探讨肝细胞癌中与索拉菲尼耐药的相关基因.方法:选取人肝癌细胞株PLC及Huh7,采用药物间歇诱导法分别建立索拉菲尼诱导的耐药细胞株,运用高通量测序技术(RNA-Seq)测定两株耐药细胞株中高表达基因,运用生物信息学数据库分析高表达基因与肝癌临床生物学指标相关性,筛选出肝癌耐药机制中可能参与的基因.结果:通过基因测序得到两株肝癌耐药细胞株中的高表达基因,在设定的限定条件下进行进一步筛选,限定条件为两株耐药细胞中共同表达的基因且表达差异倍数大于4倍,差异具有统计学意义(P＜0.05),发现两株耐药细胞共同表达前12位基因符合限定条件,进一步运用Ualcan数据库分析12个基因与肝癌组织表达水平、分期、分级及生存的关系,筛选出符合条件的基因CBX4.结论:成功构建了索拉菲尼诱导的肝癌耐药细胞株,并筛选出与索拉菲尼耐药相关基因CBX4,为进一步耐药机制探讨提供依据.