基于生物信息学分析STAT3、Grim19在卵巢癌中的表达及临床意义

• 作者: 杨梦莹 王亦如 阳志军
• 来源期刊: 华中科技大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 卵巢癌 STAT3 Grim19 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 266-274
• 页数: 9页
• 分类号: R737.31
• 字数: 5423字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-0741.2020.03.004

摘要

目的 研究STAT3、Grim19在卵巢癌中的表达情况、潜在功能、预后评估及临床意义.方法 利用NCBI、UCSC、UniProt数据库检索STAT3、Grim19基本信息.使用PubMed数据库检索与STAT3、Grim19相关文献.利用GEPIA在线工具分析STAT3、Grim19蛋白之间的相关性.下载肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中包含STAT3、Grim19表达水平的卵巢浆液性囊腺癌临床病例资料并作生存分析.利用在线工具LinkedOmics筛选STAT3、Grim19相关基因.利用Omicshare在线软件对相关基因进行GO功能注释富集分析与KEGG通路富集分析.收集广西医科大学附属肿瘤医院2013年1月～2017年12月经手术治疗的115例上皮性卵巢癌标本,采用免疫组化法(IHC)检测STAT3、Grim19表达水平,并分析二者与预后评估的关系.结果 STAT3、Grim19表达水平具有组织学特异性,STAT3在多种恶性肿瘤中表达上调,Grim19在多种恶性肿瘤中表达下调,且二者呈负相关.TCGA临床数据显示,STAT3高表达组中位生存时间与低表达组无明显差异(P>0.05),Grim19高表达组中位生存时间长于低表达组(P<0.05).在检测的6426个基因中,2785个基因与STAT3具有相关性(P<0.05),其中相关系数最大的基因为DNAAF2;4960个基因与Grim19具有相关性(P<0.05),其中相关系数最大的基因为NDUFB7.GO功能注释富集分析结果显示,STAT3主要涉及生物学过程为细胞过程、单一生物过程、代谢过程、刺激反应等;主要涉及分子功能为结合、催化活性、信号转导活性等;主要涉及细胞组成为细胞质、细胞膜、细胞器等.Grim19主要涉及生物学过程为细胞过程、代谢过程、细胞组分组织或合成等;主要涉及分子功能为结合、催化活性、结构分子活性等;主要涉及细胞组分为细胞质和细胞器.KEGG通路富集分析结果显示,STAT3主要参与的细胞过程为分解和代谢,作用机体系统为免疫系统和内分泌系统,涉及细胞信号转导功能,在多种传染性疾病与恶性肿瘤中作用显著;Grim19信号通路在神经退行性疾病、内分泌和恶性肿瘤疾病中作用明显,参与如能量代谢、核苷酸代谢等多种生物学代谢过程(P<0.05).广西医科大学附属肿瘤医院收集的115例临床病例标本IHC结果示,在上皮性卵巢癌中,STAT3、Grim19的表达水平与患者中位生存时间无明显相关,差异无统计学意义(P>0.05),Cox模型示年龄可能是影响上皮性卵巢癌的独立危险因(P<0.05).结论 Grim19有望成为评价卵巢癌预后的指标之一,可能经由STAT3调控卵巢癌疾病进展;STAT3经多种信号通路介导卵巢癌发生发展和耐药机制,有望成为卵巢癌靶向治疗的靶标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阳志军	广西医科大学肿瘤医院妇科	75	290	8.0	12.0
5	王亦如	广西医科大学肿瘤医院妇科	2	0	0.0	0.0
9	杨梦莹	广西医科大学肿瘤医院妇科	1	0	0.0	0.0