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摘要:
目的:寻找致心律失常性右室心肌病(ARVC)发病关键基因.方法:从GEO数据库获得人类ARVC现有信息芯片,筛选出ARVC心肌和正常心肌间差异基因.通过David数据库进行基因本体论(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,利用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络.结果:共鉴定出101个差异基因,包括40个上调基因和61个下调基因.GO分析显示,P<0.01且基因数>10的生物过程(BP)包括炎症反应和信号转导,细胞组分(CC)包括细胞膜、细胞外空间和细胞外区域.KEGG分析显示,P<0.01的通路为肿瘤坏死因子(TNF)信号通路.经过PPI分析筛选得出10个关键基因:白细胞介素6(IL-6)、CCL2、AIF1、CD 14、CCR1、FCER1G、FPR1、PTGS2、S100A9和S100A8.结论:ARVC的发生发展可能与炎症机制密切相关,可作为潜在的治疗靶点为ARVC进一步研究提供依据.
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文献信息
篇名 基于GEO数据库芯片的致心律失常性右室心肌病关键基因筛选与生物信息学分析
来源期刊 临床心血管病杂志 学科 医学
关键词 致心律失常性右室心肌病 关键基因 GEO数据库 生物信息分析
年,卷(期) 2020,(6) 所属期刊栏目 心律失常
研究方向 页码范围 516-522
页数 7页 分类号 R542.2
字数 语种 中文
DOI 10.13201/j.issn.1001-1439.2020.06.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 赵韧 28 81 5.0 8.0
2 王翠 5 9 2.0 3.0
3 沈兵 20 73 4.0 8.0
4 梁士楚 2 0 0.0 0.0
5 常龄予 2 0 0.0 0.0
6 张士涵 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
致心律失常性右室心肌病
关键基因
GEO数据库
生物信息分析
研究起点
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期刊影响力
临床心血管病杂志
月刊
1001-1439
42-1130/R
大16开
武汉解放大道1277号
38-123
1985
chi
出版文献量(篇)
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