基于MSAP技术的中国野生大豆群体遗传多样性分析

• 作者: 刘晓冬 曹莹 燕雪飞 王玉民 董英山 袁翠平 赵洪锟 郭伟
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 野生大豆 遗传多样性 纬度 MSAP 甲基化
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 384-389
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2020.03.0384

摘要

为探究中国不同纬度的野生大豆天然种群的遗传多样性及其遗传结构,本研究利用MSAP技术分析研究27°～46°N的7个野生大豆种群的DNA甲基化多态性.结果 表明:(1)223份材料、8对MSAP引物共扩增到1 617个位点,对所有位点的甲基化模式分析表明,Ⅳ型甲基化模式(位点缺失或者全甲基化)占比最多,为53.55％,Ⅱ型(半甲基化)和Ⅲ型(内侧甲基化)甲基化模式占比较少,分别为11.75％和13.25％.(2)基于非甲基化位点的Shannon指数在巴彦种群最低(I=0.279 6),在安化种群最高(I=0.313 0),遗传多样性呈现随纬度降低而逐渐升高的渐变趋势;而基于甲基化敏感位点的Shannon指数在巴彦种群最低(I=0.585 1),在桐柏种群中最高(I=0.603 0),其表观遗传多样性随纬度渐变呈现不规则波动.(3)基于非甲基化位点和甲基化敏感位点的遗传结构分析显示,在遗传上,同属于一个种群的材料能够聚类到一组,不同种群间出现了明显的遗传分化,而在表观遗传上,除了巴彦、衡山、安化的材料能各自聚类到一组以外,其余4个种群的材料交织在一起.(4)基于甲基化敏感位点的表观遗传距离和基于非甲基化位点的遗传距离相关性分析显示,二者在6个种群相关性显著,说明表观变异在多数情况下依赖于遗传变异,但也会在某些情况表现出一定的独立性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹莹	沈阳农业大学农学院	46	770	17.0	26.0
2	郭伟	沈阳农业大学农学院	65	755	12.0	26.0
3	赵洪锟	吉林省农业科学院大豆研究所	34	230	7.0	14.0
4	董英山	吉林省农业科学院大豆研究所	58	417	11.0	18.0
5	袁翠平	吉林省农业科学院大豆研究所	15	76	3.0	8.0
6	燕雪飞	沈阳农业大学农学院	29	239	10.0	14.0
7	王玉民	吉林省农业科学院大豆研究所	33	235	7.0	15.0