中国野生大豆群体特征和地理分化的遗传分析

• 作者: 丁艳来 盖钧镒 范虎 赵团结 邢光南
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 野生大豆(Glycine soja Sieb. et Zucc.) SSR 连锁不平衡(LD) 群体结构 地理分化 全生育期遗传分化
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 414-425
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.03.002

摘要

[目的]从分子标记等位变异水平上探讨中国野生大豆群体的遗传特征、连锁不平衡特点和地理生态分化的遗传机制,并以重要生态性状全生育期为代表解析性状地理分化的遗传基础.[方法]从全国24个省区不同地理生态型的野生大豆材料中抽选174份组成代表性样本,选用204个SSR标记,利用TASSEL及STRUCTURE 2.2软件进行群体连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)和群体遗传结构分析.在此基础上对群体的地理分化、亚群体特异性及全生育期位点等位变异的地理分化进行遗传分析.[结果]中国野生大豆群体蕴含丰富的遗传变异,20条连锁群中,I和C2连锁群有相对较多的位点平均等位变异和遗传分化.不论是共线性组合,还是非共线性组合,都有一定程度的LD存在,说明历史上发生过连锁群间的大量重组;野生群体D'平均值为0.34,高值多,比栽培大豆高,说明野生群体发生过更多的重组,保留下较高的LD.采用H-W平衡模型将野生群体聚成4类,模型聚类亚群划分与地理生态分类相关、有交叉,推测各地理亚群体发生过材料的迁移.各地理亚群经长期自然选择,各位点等位基因的频率发生变化,还有新生的与绝灭的,因此,各地理亚群间产生明显的等位基因分化.与地理生态性状全生育期关联的有15个位点1 60个等位变异,其中,亚群特有等位变异共58个,来自14个位点,同一位点可以在多个亚群体产生不同的特有等位变异,其效应从南至北逐渐下降,这说明生态区间不仅有强烈的遗传分化,而且是有规律的遗传分化.[结论]中国野生大豆群体遗传多样性高,共线、非共线位点间连锁不平衡程度高,4个生态亚群体间位点高度遗传分化,产生大量地区特有等位变异,全生育期还表现由南向北降效的规律性遗传分化.