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红斑丹毒丝菌分离鉴定及主要保护性抗原基因遗传进化分析
红斑丹毒丝菌分离鉴定及主要保护性抗原基因遗传进化分析
作者:
张莹
文雪霞
杨婷婷
邵晴青
陈旭
陈晓月
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
红斑丹毒丝菌
spaA
生物信息学分析
摘要:
红斑丹毒丝菌(Erysipelothrix rhusiopathiae)是引起急性、热性猪丹毒的病原菌,是人兽共患病的病原.猪丹毒临床症状和病理变化与非洲猪瘟的症状和病理变化极为相似,容易混淆.从病死猪的肝脏和肺脏中分离到两株革兰氏阳性短杆菌,进行生化试验和药敏试验,并扩增16S rDNA和主要表面保护性抗原(spaA)基因并测序.将纯化后的细菌接种小鼠,测定分离菌的致病性.以国内外已发表的32条spaA基因序列为参考,用DNAstar软件分析分离菌spaA基因的遗传进化关系.登录生物信息学网站在线预测spaA蛋白三级结构.结果表明:两株分离株16S rDNA基因序列与GenBank中丹毒丝菌序列同源性达90%以上,确定为丹毒丝菌,分别命名为LN201801和LN201802.分离菌株均能分解葡萄糖、果糖、乳糖,不分解蔗糖、甘露醇和山梨醇,MR试验和V-P试验均为阴性.LN201801和LN201802对青霉素和头孢噻肟高度敏感,对杆菌肽、恩诺沙星、阿奇霉素耐药.分离菌株spaA基因长1881bp,与已知强毒株Fujisawa序列同源性为99.9%.系统进化树分析表明,LN201801、LN201802与合肥分离株、安徽分离株、湖南分离株、 湖北分离株位于同一分支上,提示该病可能存在跨地区传播.蛋白质在线预测结果显示,spaA蛋白分子量为72.294ku,分子式为C3260H5104N854O956S23,为脂溶性蛋白,性质稳定.该蛋白有337个B细胞表位,两个主要结构域(domain).本研究为猪丹毒的诊断和治疗提供了方法,为该病的防控和开发亚单位疫苗提供候选菌株.
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文献信息
篇名
红斑丹毒丝菌分离鉴定及主要保护性抗原基因遗传进化分析
来源期刊
沈阳农业大学学报
学科
农学
关键词
红斑丹毒丝菌
spaA
生物信息学分析
年,卷(期)
2020,(3)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
257-264
页数
8页
分类号
S852.65
字数
4838字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-1700.2020.03.001
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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研究主题发展历程
节点文献
红斑丹毒丝菌
spaA
生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
沈阳农业大学学报
主办单位:
沈阳农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-1700
CN:
21-1134/S
开本:
大16开
出版地:
沈阳市东陵路120号
邮发代号:
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
3479
总下载数(次)
6
总被引数(次)
38738
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