绒山羊ALX4基因多态性与绒毛性状相关性分析

• 作者: 刘斌 吴铁成 张治龙 李玉荣 蔡原 赵生国 赵霞 马跃军
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绒山羊 无根状同源异型盒-4(ALX4)基因 多态性
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1431-1440
• 页数: 10页
• 分类号: S827
• 字数: 5330字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2020.08.010

摘要

在绒山羊(Capra hircus)绒毛生长发育的过程中,不同基因的表达调控在毛囊代谢中发挥着重要作用.本研究选择无根状同源异型盒-4(aristaless-like homeobox 4,ALX4)为候选基因,旨在验证ALX4基因与绒山羊绒毛性状的相关性,为绒山羊分子标记辅助选育提供依据.首先提取20只绒细度处于最高和最低绒山羊血液DNA,采用PCR扩增技术对ALX4基因的3'-UTR、5'-UTR、外显子、启动子序列进行扩增并测序.根据Blast比对结果,统计ALX4基因发生突变的SNP位点,再利用竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele-Specific PCR,KASP)基因分型技术对315只绒山羊个体进行检测,应用一般线性模型进行SNPs位点与绒毛性状的相关性分析.结果表明,ALX4基因启动子区存在SNP1(T-1700C),3'-UTR区存在SNP2(T-14621C)、SNP3(T-15433C)、SNP4(G-16377C)、SNP5(A-17780G)和SNP6(A-18044G),每个位点均符合Hardy-Weinberg平衡.相关性分析显示,ALX4基因SNP4位点与毛长性状显著相关(P<0.05),GG基因型个体毛长显著高于CC型和CG型个体(P<0.05);SNP6位点与绒细性状显著相关(P<0.05),AA型个体绒细度显著高于GG型和AG型个体(P<0.05);ALX4基因3'-UTR区5个SNPs的不同单倍型组合与毛长性状显著相关(P<0.05),H1H1个体毛长显著高于HIH7、H1H12、H4H7和H7H7(P<0.05).以上结果表明,ALX4基因可以作为绒山羊分子标记辅助选育的关键基因,在绒山羊育种工作中可以选择SNP6位点AG基因型个体进行超细绒山羊选育.