探索染色质三维构象的“工具箱”研究进展

• 作者: 张斯姮 张智慧 徐伟泽 曹罡 李国亮 林达 洪萍
• 来源期刊: 中国科学（生命科学）
• 关键词: 三维基因组学 染色体构象 Hi-C DLO Hi-C ChIA-PET FISH
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 溯本求源大“烤”问:基因组多维结构和动植物基因组结构差异专题
• 页码范围: 497-505
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/SSV-2019-0224

摘要

三维基因组学是研究基因组三维空间结构与功能的一门学科.基于不同的研究目的和生物学问题,目前发展出了各种各样的三维基因组学研究方法,这些方法对推动三维基因组学发展有积极的影响.本文以三维基因组学的提出和发展过程为线索,对三维基因组学的主要研究方法进行了系统地归类与介绍,包括基于测序技术(基于邻近连接)的Hi-C,capture Hi-C,single-cell Hi-C,DLO Hi-C,ChIA-PET,Hi-ChIP等;基于测序技术(不基于邻近连接)的ChIA-Drop,SPRITE,GAM;以及基于影像技术的seqFISH,CRISPRainbow,SABER amplifies FISH.最后,本文对染色体构象捕获技术的发展方向进行了简单的展望.