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小鼠高糖记忆模型中足细胞向上皮间质细胞转化的转录组学分析
小鼠高糖记忆模型中足细胞向上皮间质细胞转化的转录组学分析
作者:
周波
张娇
张路
杨彩莲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
高糖
上皮间质转化
代谢记忆
转录组测序
足细胞
摘要:
目的 探讨小鼠高糖记忆模型中足细胞向上皮间质细胞转化(EMT)的机制.方法 将小鼠肾小球足细胞分为4组:正糖组(5.5 mmol/L D-葡萄糖)、高糖组(30 mmol/L D-葡萄糖)、记忆组(先30 mmol/L D-葡萄糖,后5.5 mmol/L D-葡萄糖)、渗透压组(5.5 mmol/L D-葡萄糖+24.5 mmol/L甘露醇),除记忆组作用96 h外,其余组均作用48 h.Western blotting及免疫荧光检测各组足细胞EMT指标肾病蛋白(Nephrin)及α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)的表达.采用Illumina HiSeq 2000进行正糖组、高糖组及记忆组的转录组测序,DESeq鉴定差异表达基因,并对差异表达基因进行GO及KEGG富集分析.最后采用实时荧光定量PCR检测差异表达基因的表达.结果 与正糖组相比,Western blotting与免疫荧光检测均显示高糖组与记忆组的足细胞Nephrin表达减少、α-SMA表达增加(P<0.05),而渗透压组与正糖组,记忆组与高糖组足细胞Nephrin、α-SMA的表达差异无统计学意义(P>0.05).RNA测序结果显示,高糖组及正糖组间存在194个差异表达基因,其中119个上调,75个下调,而记忆组及正糖组间则有532个差异表达基因,包含316个上调基因,216个下调基因.进一步比对上述差异基因,发现有108个基因(35个上调,73个下调)在高糖组及记忆组间存在相似的表达规律.GO富集分析显示10条GO词条有显著性富集意义,KEGG通路富集分析显示TGF-β、黏着斑、Rap1及干细胞的多能调节等信号通路有显著性富集意义.PCR结果示高糖组及记忆组的Smad9、Snai1、Mapkapk3表达明显高于正糖组,Igf1、Fgf22、Lama1及Zfhx3的表达明显低于正糖组.结论 高糖可诱导足细胞发生EMT,且存在"记忆现象".该现象的发生可能与TGF-β、黏着斑、Rap1、干细胞的多能调节等信号通路,以及Smad9、Snai1、Mapkapk3的上调,Igf1、Fgf22、Lama1及Zfhx3的下调有关.
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文献信息
篇名
小鼠高糖记忆模型中足细胞向上皮间质细胞转化的转录组学分析
来源期刊
解放军医学杂志
学科
医学
关键词
高糖
上皮间质转化
代谢记忆
转录组测序
足细胞
年,卷(期)
2020,(2)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
162-170
页数
9页
分类号
R587.2
字数
4926字
语种
中文
DOI
10.11855/j.issn.0577-7402.2020.02.09
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
周波
重庆医科大学附属第一医院内分泌内科
84
303
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2
张娇
重庆医科大学附属第一医院内分泌内科
1
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杨彩莲
重庆医科大学附属第一医院内分泌内科
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张路
重庆医科大学附属第一医院内分泌内科
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研究主题发展历程
节点文献
高糖
上皮间质转化
代谢记忆
转录组测序
足细胞
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
解放军医学杂志
主办单位:
人民军医出版社
出版周期:
月刊
ISSN:
0577-7402
CN:
11-1056/R
开本:
大16开
出版地:
北京100036信箱188分箱
邮发代号:
2-74
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
8116
总下载数(次)
11
总被引数(次)
57068
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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