甜瓜circRNA及其蔓枯病抗性靶基因鉴定

• 作者: 任琴琴 包卫红 孙亚亭 钱春桃 陈雯倩 陈静 鲁秀梅
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甜瓜 蔓枯病 circRNA 靶基因
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 植物科学
• 页码范围: 629-636
• 页数: 8页
• 分类号: S652.9
• 字数: 5543字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201912037

摘要

[目的]本文旨在通过甜瓜接种蔓枯病菌前、后circRNA的研究及靶基因的筛选验证,探究circRNA在甜瓜抗蔓枯病过程中的作用.[方法]利用感病品种'白皮脆'和抗病材料PI420145,分别在接种前、后取样,构建circRNA文库,通过RNA-Seq、Real-time PCR验证以及基因结构分析,探索circRNA在抗蔓枯病过程中的作用.[结果]12个circRNA文库中共鉴定出3136个circRNA,过滤后共获得1511个circRNA.聚类分析结果表明,circRNA的种类和表达具有品种差异性,且接种蔓枯病菌会引起circRNA的变化.接种蔓枯病菌前、后,在PI420145和'白皮脆'中分别筛选到4个和3个差异表达的circRNA,其中1个circRNA在2种材料中都有差异表达;对6个靶标基因的结构域分析及RT-qPCR分析结果表明,MELO3C022310、MELO3C002560和MELO3C010763基因与甜瓜蔓枯病抗性相关.[结论]circRNA参与了甜瓜材料PI420145对蔓枯病入侵的防御反应.