基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
目的 通过GEO数据库和生物信息学分析,寻找食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carci-noma,ESCC)潜在的血清学标志物,并探讨其在ESCC筛查诊断中的应用价值.方法 通过GEO数据库(GSE38129)对ESCC患者癌组织和癌旁组织各30例样本进行分析,筛选出表达差异最明显的mRNA-基质金属蛋白酶1(matrix metalloproteinase 1,MMP1),并进一步通过在线基因表达谱分析工具(gene expression profi-ling interactive analysis,GEPIA)验证MMP1在癌组织和癌旁组织(para-cancerous tissues,PCT)的表达差异和预后的相关性.随后采用电化学发光免疫分析仪检测食管癌患者(109例)及健康人群(110例)血清样本中鳞状细胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen,SCC)、癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)、细胞角蛋白19片段(cytokeratin 19 fragment antigen 21-1,CYFRA21-1)的浓度,同时双抗体夹心酶联免疫吸附法检测血清MMP1浓度.结果 在GEO数据库(GSE38129)中MMP1的表达差异最为明显(logFC=4.849,P=7.90E-12).在GEPIA数据库182例癌组织和286例癌旁样本中MMP1表达也有差异(P<0.05),生存分析显示MMP1与ESCA的总体生存率(Logrank P=0.4)和无瘤生存率(Logrank P=0.73)无关.ESCC患者血清MMP1、CEA、CYFRA21-1和SCC浓度均明显高于对照组的健康体检者(P<0.05);ESCC患者血清MMP1、CEA、CYFRA21-1和SCC浓度均随肿瘤分期升高而升高,呈正相关;血清MMP1和SCC联合检测ESCC的诊断灵敏度和特异性分别为82.13%和76.80%.结论 外周血MMP1和SCC联合检测能显著提高ESCC的灵敏度与特异性,有利于ESCC的筛查诊断.
推荐文章
应用生物信息学筛选前列腺癌潜在生物标志物
前列腺癌
生物信息学
基因芯片
差异表达基因
食管癌血清肿瘤标志物诊断价值的研究
食管癌
肿瘤标志
肿瘤相关物质群
谷胱甘肽转移酶
癌胚抗原
血清肿瘤标志物及其组合模式对肺癌诊断及分型的价值研究
肺癌
血清肿瘤标志物
诊断
受试者工作特征曲线
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 食管癌血清标志物的生物信息学筛选及其临床诊断价值验证
来源期刊 转化医学杂志 学科 医学
关键词 食管鳞状细胞癌 血清基质血清金属蛋白酶1 癌胚抗原 细胞角蛋白19片段
年,卷(期) 2020,(6) 所属期刊栏目 肿瘤与转化
研究方向 页码范围 351-355
页数 5页 分类号 R735.1|R730.4
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.2095-3097.2020.06.007
五维指标
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (55)
共引文献  (7)
参考文献  (10)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
1900(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1992(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1993(4)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(4)
1994(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1995(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1997(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1998(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1999(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2002(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2003(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2004(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2005(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
2006(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2007(6)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(6)
2008(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2009(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2011(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2012(2)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(1)
2013(3)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(2)
2014(4)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(3)
2015(2)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(1)
2016(10)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(7)
2017(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
2018(6)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(6)
2019(4)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(1)
2020(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
食管鳞状细胞癌
血清基质血清金属蛋白酶1
癌胚抗原
细胞角蛋白19片段
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
转化医学杂志
双月刊
2095-3097
10-1042/R
大16开
北京市海淀区阜成路6号
1988
chi
出版文献量(篇)
938
总下载数(次)
2
论文1v1指导