RANBP9调控结直肠癌细胞凋亡的信号通路分析

• 作者: 李吉 武广彬 秦春枝
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: RANBP9 凋亡 基因芯片 结直肠癌
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1177-1186
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2020.07.0005

摘要

RANBP9是RAS超家族成员RAN的一种结合蛋白,参与多种肿瘤的发生发展.为探索它对结直肠癌细胞凋亡的调控作用,该研究利用慢病毒感染结直肠癌HCT116、HT29细胞的方法,建立RANBP9-shRNA稳转细胞系,经氟尿嘧啶诱导凋亡后利用流式细胞仪和caspase-2酶活力实验检测细胞凋亡;抽提实验组和对照组HCT116细胞总RNA,经质检合格后进行基因表达谱芯片实验,筛选出RANBP9敲减前后结直肠癌细胞的差异表达基因并进行定量PCR验证,基于Gene Ontology数据库进行分子功能注释,基于Ingenuity Pathway Analysis数据库进行通路分析.流式细胞分析显示,在HCT116和HT29细胞中RANBP9-shRNA均促进氟尿嘧啶诱导的细胞凋亡;基因芯片数据分析得到差异表达mRNAs 857个(|Fold Change|＞1.5且FDR＜0.05),其中上调表达677个,下调表达180个,涉及的分子功能主要包括γ-谷氨酰转移酶活性、钙离子结合、胰岛素受体结合、病毒受体活性、GTP酶活性、细胞外基质结合、β-连环蛋白结合、SMAD结合、转录调节、AMP活化蛋白激酶活性、蛋白质转运蛋白活性、细胞骨架结合等,其显著参与的信号通路主要涉及癌症的TGF-β、BMP、IL-8和RhoA等.实时定量PCR证实上述通路中的SMAD3、SMAD7、BMP6、BMP7、CXCL8、RAPGEF6的mRNA表达水平在RANBP9-shRNA组中显著高于对照组.综上,RANBP9可能通过多个信号通路来调控结直肠癌细胞的凋亡,该研究为阐明其中的分子机制提供了新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	武广彬		3	14	1.0	3.0
2	李吉		11	37	4.0	5.0
3	秦春枝		5	10	1.0	3.0