eTM、 microRNA319及其调控靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式

• 作者: 厉雪 张梓浩 林玉玲 苏立遥 蒋梦琦 赖钟雄 陈旭 黄倏祺
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 关键词: 龙眼 miR319 内源诱捕靶标 靶基因 体胚发生
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 566-573
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.07062

摘要

MicroRNA319作为最保守的miRNA家族之一,在植物器官形态建成、激素信号转导、抵抗外界胁迫等途径中均有重要作用.为了解miR319在植物体胚中的调控途径,利用龙眼转录组数据库筛选miR319成熟体(miR319)和前体序列(pre-miR319),并通过DNAMAN 6.0和Mfold分析miR319的定位和pre-miR319的二级结构;进而采用TAPIR和psRNAtarget预测选定的miR319成员的内源诱捕靶标(endogenous target mimics,eTM)及候选靶标,并通过RLM-RACE验证靶标裂解位点,最后分析eTM、miR319及其靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式.结果显示,龙眼4个miR319成员有1个定位于miR319a scafflod517,有3个定位于miR319a scaffold225.因此,以miR319a scaffold225为研究对象,将其命名为pre-miR319a,其上的成熟体分别命名为miR319a-3p.1、miR319a-5p.1和miR319a-5p.2.裂解位点显示龙眼miR319a 3个成员中,miR319a-3p.1的靶基因为TCP2和TCP4 (Dlo_022819.1,Dlo_026743.1),miR319a-5p.1的靶基因为吲哚-3-甘油磷酸合成酶(IGS)和ABI3-5抑制因子,miR319a-5p.2未验证到靶基因.qPCR显示,在龙眼早期体胚发生过程中,miR319a 3个成员的表达模式基本一致,呈显著上调趋势.另外,除eTM8637外,其余eTM的表达模式与其相应的miR319a成员基本呈现为负相关趋势,均为下调趋势.miR319a-3p.1与其靶基因基本呈现为负调控趋势,miR319a-5p.1与ABI3-5抑制因子在龙眼早期体胚发生后期呈现负调控,与IGS没有明显负相关.本研究初步验证了“eTM-miR319a-靶基因”信号途径可能参与到龙眼早期体胚发生的形态建成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄		473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲		148	560	10.0	16.0
3	张梓浩		37	72	5.0	5.0
4	陈旭		18	17	3.0	3.0
5	苏立遥		8	0	0.0	0.0
6	黄倏祺		5	0	0.0	0.0
7	蒋梦琦		5	0	0.0	0.0
8	厉雪		4	2	1.0	1.0