通过生物信息学筛选与结直肠癌转移相关的基因及在结直肠癌转移研究中的应用

• 作者: 吴骁 张甜甜 王俊斌 苏方 高振远
• 来源期刊: 赣南医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 转移性结直肠癌 生物信息学 核心基因
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 肿瘤学·基础与临床
• 页码范围: 366-372
• 页数: 7页
• 分类号: R735.3+7
• 字数: 2599字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-5779.2020.04.009

摘要

目的:通过生物信息学筛选与结直肠癌转移相关的关键基因,研究关键基因与结直肠癌生存预后的关系,并评估其作为生物标志物的预测价值.方法:从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库筛选出GSE68468和GSE81558的表达谱,分析结直肠癌原发性肿瘤与转移性肿瘤之间差异表达的基因(Differentially expressed genes,DEGs).构建了DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络找出核心基因等.结果:本研究纳入两个GEO数据集(GSE68468和GSE81558),筛选出95个DEGs,其中上调的基因76个,下调的基因19个.从PPI网络中筛选出26个与结直肠癌远处转移相关的核心基因.并进一步分析出TTR,AHOP,APOC3,PLG与总生存率(overall survival,OS)有显著相关性.结论:通过生物信息学方法筛选与结直肠癌转移密切相关的核心基因,为探索新的干预治疗措施提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王俊斌	蚌埠医学院第一附属医院肿瘤科	21	103	5.0	9.0
2	高振远	蚌埠医学院第一附属医院肿瘤科	12	29	3.0	5.0
3	吴骁	蚌埠医学院第一附属医院肿瘤科	2	3	1.0	1.0
4	苏方	蚌埠医学院第一附属医院肿瘤科	10	90	3.0	9.0
5	张甜甜	蚌埠医学院第一附属医院肿瘤科	5	5	1.0	2.0