清水江斑鳜COI基因序列分析

• 作者: 余科 安苗 潘秋芝 黄胜
• 来源期刊: 贵州畜牧兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 清水江斑鳜 种质资源 COI基因序列 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 品种资源
• 页码范围: 5-10
• 页数: 6页
• 分类号: S932.4|Q78
• 语种: 中文

摘要

为了解清水江斑鳜的遗传多样性,试验采集清水江凯里江段和天柱江段2个站点的斑鳜种群个体51尾,利用PCR扩增技术进行细胞色素氧化酶I亚基(COI)基因测序分析.结果:51个斑鳜样品中,COI基因序列长度为962 bp,共检测到9个多态位点,保守位点952个.其中转换、颠换的位点数分别有7个和2个,不存在转换与颠换共存的基因位点;碱基A+T和C+G的平均含量分别为53.3％和46.7％.清水江斑鳜单倍型多样度为0.65020,平均遗传距离为0.0026.凯里江段斑鳜样品中核苷酸多样性为0.00109,平均核苷酸差异数为1.04923;天柱江段斑鳜样品中核苷酸多样性为0.00131,平均核苷酸差异数为1.26000.51尾个体中包含9个单倍型,2个江段群体间存在共有同一单倍型的情况.在构建的邻接系统进化树中,51个斑鳜样品聚为1支,且置信度高,亲缘关系很接近;与另外8支参照斑鳜归为1支,亲缘关系较近.结论:清水江斑鳜的遗传多样性较为丰富,且2个群体的遗传谱系更接近于洞庭湖和鄱阳湖的斑鳜群体;其中天柱江段斑鳜的遗传多样性比凯里江段斑鳜高,遗传资源更为丰富.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	安苗		93	620	15.0	18.0
2	余科		4	0	0.0	0.0
3	黄胜		7	6	1.0	2.0
4	潘秋芝		4	1	1.0	1.0