2018年大庆市某规模化猪场PEDV检测及S1基因遗传变异分析

• 作者: 孙东波 张金悦 苏明俊 陈文文 高飞
• 来源期刊: 黑龙江八一农垦大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: PEDV S1基因 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 29-37
• 页数: 9页
• 分类号: Q858.28
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2090.2020.06.005

摘要

为调查2018年大庆市某规模化猪场猪流行性腹泻病毒(PEDV)的感染及遗传变异情况,应用RT-PCR方法,对该规模化猪场的两个分场的仔猪腹泻样品进行PEDV S1基因扩增、测序及遗传进化分析.结果表明两个分场均存在PEDV感染;序列分析显示,两个分场PEDV S1基因序列核苷酸同源性为98.3％,推导氨基酸同源性为97.7％,与我国HGC-01-2015野毒株核苷酸同源性最高为99.0％,与2014年日本流行毒株ZK-O型毒株核苷酸同源性最低为84.9％.PEDV S1基因系统进化树分析显示,实验鉴定毒株均属于GⅡb亚群,与近年国内流行毒株及黑龙江省地区的流行毒株亲缘关系较近,与早期经典毒株CV777型毒株及国外流行毒株亲缘关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高飞		31	69	5.0	7.0
2	孙东波		49	95	5.0	8.0
3	苏明俊		5	0	0.0	0.0
4	陈文文		2	0	0.0	0.0
5	张金悦		1	0	0.0	0.0