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摘要:
目的 谷氨酰内切酶C(Glu C)可特异地切割蛋白谷氨酸或天冬氨酸残基羧基端结合的肽键,是蛋白质组学研究的重要工具酶,优质高效价廉的Glu C产品对蛋白质组学研究意义重大.在课题组前期成功制备重组表达Glu C基础上,应用非标记定量蛋白质组学技术对实验室自制Glu C与市售商品化产品Glu C(Glu C-Com)的活性进行系统的评价比较.方法 等量酵母全细胞蛋白裂解物(total cell lysates,TCL)分别用等量的实验室自制Glu C与Glu C-Com消化,酶解肽段经液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)检测,产生的数据经MaxQuant(v1.5.2.8)软件的非标记定量(LFQ)方法 分析.结果 Glu C消化样品后产生的易于质谱鉴定分析的肽段(7~35个氨基酸)的总体数目更多,且肽段的丰度范围分布更广;其二级谱图鉴定率、二级谱图数、肽段数量、蛋白鉴定数量等指标均比Glu C-Com组高,且漏切率较低.结论 应用基于质谱的非标记定量蛋白质组学技术可实现对Glu C的酶活性评价,数据显示实验室制备的Glu C具有较好的生物活性.
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文献信息
篇名 基于非标记定量蛋白质组学的谷氨酰内切酶C活性研究
来源期刊 军事医学 学科 生物学
关键词 谷氨酰内切酶C 质谱 非标记定量蛋白质组学
年,卷(期) 2020,(6) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 438-442
页数 5页 分类号 Q503
字数 4223字 语种 中文
DOI 10.7644/j.issn.1674-9960.2020.06.008
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质谱
非标记定量蛋白质组学
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